RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 FGFR3P22607 806 aa20.37■□□□□ 0.85
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SH3BP2-218ENST00000511185 TPRNQ4KMQ1 711 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
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SH3BP2-218ENST00000511185 PIK3R5Q8WYR1 880 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 KIF12Q96FN5 646 aa20.37■□□□□ 0.85
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SH3BP2-218ENST00000511185 RNF135Q8IUD6 432 aa20.33■□□□□ 0.85
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SH3BP2-218ENST00000511185 FBXW11Q9UKB1 542 aa20.33■□□□□ 0.85
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SH3BP2-218ENST00000511185 C2CD4DB7Z1M9 353 aa20.32■□□□□ 0.84
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SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM213AQ9BRX8 229 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 EXOC7Q9UPT5 735 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 NUB1Q9Y5A7 615 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 PRR29P0C7W0 189 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 MTHFRP42898 656 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 ALCAMQ13740 583 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM132DQ14C87 1099 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 SYCP3Q8IZU3 236 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 KREMEN2Q8NCW0 462 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 SUSD3Q96L08 255 aa20.31■□□□□ 0.84
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