RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497870.1

PLS3-208, Transcript of plastin 3, human

TSL 4

Gene PLS3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLS3-208	ENST00000497870	SRRD	Q9UH36	339 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PLS3-208	ENST00000497870	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PLS3-208	ENST00000497870	NRP1	O14786	923 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	AKR1B10	O60218	316 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	ALDH2	P05091	517 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	CTSS	P25774	331 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	PEX2	P28328	305 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	MAN2A2	P49641	1150 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	NPEPPS	P55786	919 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	PPP3CA	Q08209	521 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	MST1L	Q2TV78	715 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	RNF220	Q5VTB9	566 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	NPNT	Q6UXI9	565 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	AMER2	Q8N7J2	671 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	ZNF480	Q8WV37	535 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	SNX33	Q8WV41	574 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	IL17RA	Q96F46	866 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	BCO1	Q9HAY6	547 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	XDH	P47989	1333 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870		A0A088AWK7	358 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	CREB3	O43889	395 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	PRAMEF4	O60810	478 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	ZNF202	O95125	648 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	PEX11B	O96011	259 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	CRHR1	P34998	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	HK3	P52790	923 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	PER3	P56645	1201 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	NOG	Q13253	232 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	TUBA3C	Q13748	450 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	FGL2	Q14314	439 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	LLGL1	Q15334	1064 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	UBE3C	Q15386	1083 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	ATP2B3	Q16720	1220 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	METTL24	Q5JXM2	366 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	RSPH3	Q86UC2	560 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	PGBD4	Q96DM1	585 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	MNT	Q99583	582 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	CFAP69	A5D8W1	941 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870		A6NNZ2	444 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	TEX33	O43247	280 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	SETSIP	P0DME0	302 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	SMARCA1	P28370	1054 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	CASR	P41180	1078 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	TM4SF4	P48230	202 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	CSRP2	Q16527	193 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	LONRF1	Q17RB8	773 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870		Q6ZPA2	131 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	DOK3	Q7L591	496 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	SRL	Q86TD4	932 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	OR7D4	Q8NG98	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	DPF2	Q92785	391 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63

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