RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	RDM1	Q8NG50	284 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	GJA10	Q969M2	543 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAMTS3	O15072	1205 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	ERLIN2	O94905	339 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	CNNM3	Q8NE01	707 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC5A5	Q92911	643 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	LENG9	Q96B70	501 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	USP18	Q9UMW8	372 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	TGM5	O43548	720 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRN2	O75325	713 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	MLH1	P40692	756 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	USP11	P51784	963 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	RCAN1	P53805	252 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	NLRP5	P59047	1200 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	GPC5	P78333	572 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	HTR4	Q13639	388 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	B3GALT6	Q96L58	329 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	APOL6	Q9BWW8	343 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	12.07	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	MARCH5	Q9NX47	278 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	POLI	Q9UNA4	740 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	CEP250	Q9BV73	2442 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	ANHX	E9PGG2	379 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	GLUL	P15104	373 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	SCNN1G	P51170	649 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	STARD6	P59095	220 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMC5	P62195	406 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	DSG1	Q02413	1049 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	CREM	Q03060	361 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	LMNB2	Q03252	620 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT32	Q14532	448 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	USP41	Q3LFD5	358 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	LIN9	Q5TKA1	542 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	HACE1	Q8IYU2	909 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	TBCK	Q8TEA7	893 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	WHAMM	Q8TF30	809 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM143	Q96AN5	459 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	BORCS6	Q96GS4	357 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	CEP170P1	Q96L14	293 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	GAD1	Q99259	594 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48

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