RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496015.5

ABCD4-217, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 5

Gene ABCD4, Length 1,248 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-217ENST00000496015 XPOTO43592 962 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 FSHRP23945 695 aa14.87□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 TKTP29401 623 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 ELF1P32519 619 aa14.87□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 BRCC3P46736 316 aa14.87□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 PPP2R3AQ06190 1150 aa14.87□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 RESTQ13127 1097 aa14.87□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 PTPAQ15257 358 aa14.87□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 SEZ6Q53EL9 994 aa14.87□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 RRAGBQ5VZM2 374 aa14.87□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 C3orf58Q8NDZ4 430 aa14.87□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 SLC7A14Q8TBB6 771 aa14.87□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 EPSTI1Q96J88 318 aa14.87□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 TSPAN18Q96SJ8 248 aa14.87□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 FBXL21Q9UKT6 434 aa14.87□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 POLIQ9UNA4 740 aa14.87□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 OGTO15294 1046 aa14.86□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 ADAM12O43184 909 aa14.86□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 STX6O43752 255 aa14.86□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 PIGRP01833 764 aa14.86□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 CXCL8P10145 99 aa14.86□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 AVPR2P30518 371 aa14.86□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 MCM4P33991 863 aa14.86□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 NUBP1P53384 320 aa14.86□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 PTPN5P54829 565 aa14.86□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 CD300LGQ6UXG3 332 aa14.86□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 APPL2Q8NEU8 664 aa14.86□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 KIF12Q96FN5 646 aa14.86□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 MSTO1Q9BUK6 570 aa14.86□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa14.86□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 FOXD4L1Q9NU39 408 aa14.86□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 WDFY4Q6ZS81 3184 aa14.86□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 TTC26A0AVF1 554 aa14.85□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 PRRG1O14668 218 aa14.85□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 CCL16O15467 120 aa14.85□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 POU2F2P09086 479 aa14.85□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 LAMP2P13473 410 aa14.85□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 GTF2BQ00403 316 aa14.85□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 NHLH1Q02575 133 aa14.85□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 SPECC1Q5M775 1068 aa14.85□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 SLFN12LQ6IEE8 588 aa14.85□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa14.85□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 SV2BQ7L1I2 683 aa14.85□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 CD302Q8IX05 232 aa14.85□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 ZNF461Q8TAF7 563 aa14.85□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 SUSD3Q96L08 255 aa14.85□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 MYADMQ96S97 322 aa14.85□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 SMOC2Q9H3U7 446 aa14.85□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 DUSP12Q9UNI6 340 aa14.85□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 MTMR6Q9Y217 621 aa14.85□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 A0A0B4J269 797 aa14.84□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 GAP43P17677 238 aa14.84□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 CYP3A5P20815 502 aa14.84□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 VCPP55072 806 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 SLC39A14Q15043 492 aa14.84□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 CTXN3Q4LDR2 81 aa14.84□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 IER5LQ5T953 404 aa14.84□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 SLC8B1Q6J4K2 584 aa14.84□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 ZNF280DQ6N043 979 aa14.84□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 FAM173BQ6P4H8 233 aa14.84□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 USP49Q70CQ1 688 aa14.84□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 DYMQ7RTS9 669 aa14.84□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 LRRC15Q8TF66 581 aa14.84□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 CLIC6Q96NY7 704 aa14.84□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa14.84□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 SEL1LQ9UBV2 794 aa14.84□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa14.84□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 CDH7Q9ULB5 785 aa14.84□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 MYH15Q9Y2K3 1946 aa14.84□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 LACTBL1A8MY62 500 aa14.83□□□□□ -0.04
ABCD4-217ENST00000496015 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ABCD4-217ENST00000496015 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ABCD4-217ENST00000496015 LRG1P02750 347 aa14.83□□□□□ -0.04
ABCD4-217ENST00000496015 RFX1P22670 979 aa14.83□□□□□ -0.04
ABCD4-217ENST00000496015 NMT1P30419 496 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ABCD4-217ENST00000496015 LRPAP1P30533 357 aa14.83□□□□□ -0.04
ABCD4-217ENST00000496015 TNFSF9P41273 254 aa14.83□□□□□ -0.04
ABCD4-217ENST00000496015 STAT6P42226 847 aa14.83□□□□□ -0.04
ABCD4-217ENST00000496015 CLCN5P51795 746 aa14.83□□□□□ -0.04
ABCD4-217ENST00000496015 ARPP19P56211 112 aa14.83□□□□□ -0.04
ABCD4-217ENST00000496015 ROR1Q01973 937 aa14.83□□□□□ -0.04
ABCD4-217ENST00000496015 SPAG1Q07617 926 aa14.83□□□□□ -0.04
ABCD4-217ENST00000496015 STK38Q15208 465 aa14.83□□□□□ -0.04
ABCD4-217ENST00000496015 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ABCD4-217ENST00000496015 TPGS2Q68CL5 300 aa14.83□□□□□ -0.04
ABCD4-217ENST00000496015 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms