RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 PDCP20941 246 aa30.37■■■□□ 2.45
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HOXB3-211ENST00000490677 SLC39A4Q6P5W5 647 aa30.37■■■□□ 2.45
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HOXB3-211ENST00000490677 NUB1Q9Y5A7 615 aa30.3■■■□□ 2.44
HOXB3-211ENST00000490677 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
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HOXB3-211ENST00000490677 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
HOXB3-211ENST00000490677 XYLBO75191 536 aa30.29■■■□□ 2.44
HOXB3-211ENST00000490677 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP30.29■■■□□ 2.442e-7■■□□□ 14.4
HOXB3-211ENST00000490677 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP30.29■■■□□ 2.44
HOXB3-211ENST00000490677 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
HOXB3-211ENST00000490677 POTEHQ6S545 545 aa30.29■■■□□ 2.44
HOXB3-211ENST00000490677 RASSF8Q8NHQ8 419 aa30.29■■■□□ 2.44
HOXB3-211ENST00000490677 DDX12PQ92771 950 aa30.29■■■□□ 2.44
HOXB3-211ENST00000490677 FGF14Q92915 247 aa30.29■■■□□ 2.44
HOXB3-211ENST00000490677 USP28Q96RU2 1077 aa30.29■■■□□ 2.44
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