RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490673.5

OPN3-206, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,816 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-206ENST00000490673 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
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OPN3-206ENST00000490673 B3GALT6Q96L58 329 aa25.07■■□□□ 1.6
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OPN3-206ENST00000490673 DERAQ9Y315 318 aa25.07■■□□□ 1.6
OPN3-206ENST00000490673 ZNF233A6NK53 670 aa25.07■■□□□ 1.6
OPN3-206ENST00000490673 CYP2J2P51589 502 aa25.07■■□□□ 1.6
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OPN3-206ENST00000490673 RTP2Q5QGT7 225 aa25.04■■□□□ 1.6
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OPN3-206ENST00000490673 LTBRP36941 435 aa25.02■■□□□ 1.6
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OPN3-206ENST00000490673 DPP3Q9NY33 737 aa25.02■■□□□ 1.6
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OPN3-206ENST00000490673 CASP4P49662 377 aa25.01■■□□□ 1.59
OPN3-206ENST00000490673 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
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OPN3-206ENST00000490673 NFIL3Q16649 462 aa25.01■■□□□ 1.59
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