RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 VCAM1P19320 739 aa14.09□□□□□ -0.15
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HDLBP-241ENST00000487169 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
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HDLBP-241ENST00000487169 SULT1E1P49888 294 aa14.07□□□□□ -0.16
HDLBP-241ENST00000487169 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
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HDLBP-241ENST00000487169 ADAM33Q9BZ11 813 aa14.07□□□□□ -0.16
HDLBP-241ENST00000487169 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.07□□□□□ -0.16
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