RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 ZNF461Q8TAF7 563 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 GPR152Q8TDT2 470 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 FGF13Q92913 245 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 ODF2LQ9ULJ1 636 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 FAM13AO94988 1023 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 SCP2P22307 547 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 LIG4P49917 911 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 KYAT1Q16773 422 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 TMEM119Q4V9L6 283 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 CD300LGQ6UXG3 332 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 BRAPQ7Z569 592 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 APPL2Q8NEU8 664 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 ZHX3Q9H4I2 956 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 DOCK6Q96HP0 2047 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 ABLIM1O14639 778 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 XPOTO43592 962 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 PI15O43692 258 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 SEZ6Q53EL9 994 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 HAUS6Q7Z4H7 955 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 GPBP1Q86WP2 473 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 CCDC105Q8IYK2 499 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 MYCT1Q8N699 235 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 DTWD2Q8NBA8 298 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 SHDQ96IW2 340 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 TBC1D17Q9HA65 648 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 ARHGEF3Q9NR81 526 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 WDFY4Q6ZS81 3184 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 KRBA1A5PL33 1030 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 PTPN2P17706 415 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 ROR1Q01973 937 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 PPP2R3AQ06190 1150 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 MCL1Q07820 350 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 SLC10A6Q3KNW5 377 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 CTXN3Q4LDR2 81 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 SLC8B1Q6J4K2 584 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 ZNF280DQ6N043 979 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 PARM1Q6UWI2 310 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 CYP4F11Q9HBI6 524 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa21.98■■□□□ 1.11
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ACTB-212ENST00000484841 K7ENM7 598 aa21.97■■□□□ 1.11
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ACTB-212ENST00000484841 TBCAO75347 108 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 CLTAP09496 248 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 CXCL8P10145 99 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 ABCD1P33897 745 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 LONP1P36776 959 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 NCKAP1LP55160 1127 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 ELMOD1Q8N336 334 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 ITFG1Q8TB96 612 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 FGF14Q92915 247 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 KIF12Q96FN5 646 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 TBC1D32Q96NH3 1257 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 REEP2Q9BRK0 252 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 PARVGQ9HBI0 331 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 PROB1E7EW31 1015 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 ATF2P15336 505 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 PDCP20941 246 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 NBL1P41271 181 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 ANGPT1Q15389 498 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 TPGS2Q68CL5 300 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 ING5Q8WYH8 240 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 DDX12PQ92771 950 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 SUSD3Q96L08 255 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 FBXL5Q9UKA1 691 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 SIT1Q9Y3P8 196 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 WDR27A2RRH5 827 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 TRAK2O60296 914 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 ABLIM3O94929 683 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 RHOP08100 348 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 CPB1P15086 417 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 GPC5P78333 572 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 PFKPQ01813 784 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 ARSHQ5FYA8 562 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 SPECC1Q5M775 1068 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 IQCEQ6IPM2 695 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 TBX20Q9UMR3 447 aa21.95■■□□□ 1.1
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