RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484266.5

CHKB-210, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 1,401 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-210ENST00000484266 PDE11AQ9HCR9 933 aa35.66■■■■□ 3.3
CHKB-210ENST00000484266 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa35.66■■■■□ 3.3
CHKB-210ENST00000484266 STK39Q9UEW8 545 aa35.66■■■■□ 3.3
CHKB-210ENST00000484266 B3GAT3O94766 335 aa35.66■■■■□ 3.3
CHKB-210ENST00000484266 MYBPC2Q14324 1141 aa35.66■■■■□ 3.3
CHKB-210ENST00000484266 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
CHKB-210ENST00000484266 NT5DC4Q86YG4 428 aa35.66■■■■□ 3.3
CHKB-210ENST00000484266 TRIML1Q8N9V2 468 aa35.66■■■■□ 3.3
CHKB-210ENST00000484266 BEST2Q8NFU1 509 aa35.66■■■■□ 3.3
CHKB-210ENST00000484266 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
CHKB-210ENST00000484266 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa35.66■■■■□ 3.3
CHKB-210ENST00000484266 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
CHKB-210ENST00000484266 SOD2P04179 222 aa35.65■■■■□ 3.3
CHKB-210ENST00000484266 CD44P16070 742 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
CHKB-210ENST00000484266 PLPP4Q5VZY2 271 aa35.65■■■■□ 3.3
CHKB-210ENST00000484266 CENPPQ6IPU0 288 aa35.65■■■■□ 3.3
CHKB-210ENST00000484266 TMC7Q7Z402 723 aa35.65■■■■□ 3.3
CHKB-210ENST00000484266 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa35.65■■■■□ 3.3
CHKB-210ENST00000484266 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
CHKB-210ENST00000484266 MBD3O95983 291 aa35.64■■■■□ 3.3
CHKB-210ENST00000484266 CTSAP10619 480 aa35.64■■■■□ 3.3
CHKB-210ENST00000484266 CYP24A1Q07973 514 aa35.64■■■■□ 3.3
CHKB-210ENST00000484266 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
CHKB-210ENST00000484266 TAS1R1Q7RTX1 841 aa35.64■■■■□ 3.3
CHKB-210ENST00000484266 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP35.64■■■■□ 3.3
CHKB-210ENST00000484266 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 NR2F2P24468 414 aa35.63■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 EDRF1Q3B7T1 1238 aa35.63■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 TCEAL5Q5H9L2 206 aa35.63■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 VWA8A3KMH1 1905 aa35.62■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa35.62■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 PPP1R2P41236 205 aa35.62■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 CASP4P49662 377 aa35.62■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 STIM1Q13586 685 aa35.62■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 SURF1Q15526 300 aa35.62■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa35.62■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 PPM1EQ8WY54 764 aa35.62■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 MFSD14AQ96MC6 490 aa35.62■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 COL6A3P12111 3177 aa35.62■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 PMS1P54277 932 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 PSMD6Q15008 389 aa35.61■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 AUTS2Q8WXX7 1259 aa35.61■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 HIDE1A8MVS5 230 aa35.6■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 PSMA7O14818 248 aa35.6■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 FAM84AQ96KN4 292 aa35.6■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 CHST7Q9NS84 486 aa35.6■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 DPP3Q9NY33 737 aa35.6■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 PTPRJQ12913 1337 aa35.6■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 PPEF2O14830 753 aa35.59■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 RPL13P26373 211 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 BRCC3P46736 316 aa35.59■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 CEP135Q66GS9 1140 aa35.59■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 B3GALT6Q96L58 329 aa35.59■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 IRAK3Q9Y616 596 aa35.59■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 SCN1AP35498 2009 aa35.59■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 ANO9A1A5B4 782 aa35.58■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 TRIM49BA6NDI0 452 aa35.58■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 C2orf71A6NGG8 1288 aa35.58■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 CXCL14O95715 111 aa35.58■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 CCNE1P24864 410 aa35.58■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 ADAM9Q13443 819 aa35.58■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 PTPN14Q15678 1187 aa35.58■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 USP41Q3LFD5 358 aa35.58■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 C9orf57Q5W0N0 161 aa35.58■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 ANKRD40Q6AI12 368 aa35.58■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 CCDC127Q96BQ5 260 aa35.58■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 TSG101Q99816 390 aa35.58■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 INTS13Q9NVM9 706 aa35.58■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 GLUD2P49448 558 aa35.57■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 DSG1Q02413 1049 aa35.57■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 LRRC63Q05C16 580 aa35.57■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 FAM171A1Q5VUB5 890 aa35.57■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 KLHL10Q6JEL2 608 aa35.57■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 WDR49Q8IV35 697 aa35.57■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 PLEKHO2Q8TD55 490 aa35.57■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 FNBP1Q96RU3 617 aa35.57■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 MTMR12Q9C0I1 747 aa35.57■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa35.57■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 NUB1Q9Y5A7 615 aa35.57■■■■□ 3.29
CHKB-210ENST00000484266 I3L4J1 428 aa35.57■■■■□ 3.28
CHKB-210ENST00000484266 PIRO00625 290 aa35.57■■■■□ 3.28
CHKB-210ENST00000484266 AKAP3O75969 853 aa35.57■■■■□ 3.28
CHKB-210ENST00000484266 URODP06132 367 aa35.57■■■■□ 3.28
CHKB-210ENST00000484266 DLATP10515 647 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.28
CHKB-210ENST00000484266 KIAA0319Q5VV43 1072 aa35.57■■■■□ 3.28
CHKB-210ENST00000484266 C1orf127Q8N9H9 656 aa35.57■■■■□ 3.28
CHKB-210ENST00000484266 OR5B17Q8NGF7 314 aa35.57■■■■□ 3.28
CHKB-210ENST00000484266 PPP2R3CQ969Q6 453 aa35.57■■■■□ 3.28
CHKB-210ENST00000484266 CGRRF1Q99675 332 aa35.57■■■■□ 3.28
CHKB-210ENST00000484266 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
CHKB-210ENST00000484266 MAPK13O15264 365 aa35.56■■■■□ 3.28
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