RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 CPNE8Q86YQ8 564 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 FAM186BQ8IYM0 893 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 SMC6Q96SB8 1091 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 PCMTD2Q9NV79 361 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 VAV3Q9UKW4 847 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 MYO3BQ8WXR4 1341 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 COMTP21964 271 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 FOXN2P32314 431 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 PHC3Q8NDX5 983 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 CFAP61Q8NHU2 1237 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 VPS37BQ9H9H4 285 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 ANAPC5Q9UJX4 755 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC42Q9Y546 428 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 ASTN1O14525 1302 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 MDH1BQ5I0G3 518 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 FAM20AQ96MK3 541 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 CHKBQ9Y259 395 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 PYGMP11217 842 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 CYP3A7P24462 503 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 DSTYKQ6XUX3 929 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD35Q8N283 1001 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 FBXO41Q8TF61 875 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 DCLRE1BQ9H816 532 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 EXOC3O60645 756 aa17.21■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 GJB6O95452 261 aa17.21■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 ALAS1P13196 640 aa17.21■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 RPL13P26373 211 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 CETN2P41208 172 aa17.21■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa17.21■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 GMCL1Q96IK5 515 aa17.21■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa17.21■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 GOLGA8RI6L899 631 aa17.21■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 Q4G0T1 1027 aa17.21■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 BTNL9Q6UXG8 535 aa17.21■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 RNF207Q6ZRF8 634 aa17.21■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF365Q70YC5 407 aa17.21■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 ASRGL1Q7L266 308 aa17.21■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 OTOP1Q7RTM1 612 aa17.21■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 ASAP3Q8TDY4 903 aa17.21■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 LMCD1Q9NZU5 365 aa17.21■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 SCN9AQ15858 1988 aa17.21■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 DCTN3O75935 186 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 NPTXRO95502 500 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 EYA4O95677 639 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 ATF2P15336 505 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 COILP38432 576 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 MTFR1Q15390 333 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 FYB2Q5VWT5 728 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 SLC35C1Q96A29 364 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 NDNQ99608 321 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 LXNQ9BS40 222 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 UNC45AQ9H3U1 944 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 PARVGQ9HBI0 331 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 PCNTO95613 3336 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 ARHGEF35A5YM69 484 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 TGFB1I1O43294 461 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 TAC1P20366 129 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 EDRF1Q3B7T1 1238 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 LDHDQ86WU2 507 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 VCX3BQ9H321 246 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 VCX3AQ9NNX9 186 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 CCPG1Q9ULG6 757 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 FZD1Q9UP38 647 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 LRCH1Q9Y2L9 728 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 GOLGA8IPA6NC78 632 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 GOLGA8JA6NMD2 632 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 ITGA8P53708 1063 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 OLFML2BQ68BL8 750 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 MAGEB18Q96M61 343 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF341Q9BYN7 854 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 ATP5HO75947 161 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 GNAZP19086 355 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 SOX5P35711 763 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 MCL1Q07820 350 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 CEP55Q53EZ4 464 aa17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms