RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 MAIP1Q8WWC4 291 aa13.07□□□□□ -0.32
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PTPRF-212ENST00000477970 CAPNS2Q96L46 248 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRF-212ENST00000477970 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PTPRF-212ENST00000477970 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
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PTPRF-212ENST00000477970 KRT5P13647 590 aa13.05□□□□□ -0.32
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PTPRF-212ENST00000477970 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PTPRF-212ENST00000477970 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
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PTPRF-212ENST00000477970 C2orf40Q9H1Z8 148 aa13.05□□□□□ -0.32
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PTPRF-212ENST00000477970 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
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PTPRF-212ENST00000477970 TULP2O00295 520 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRF-212ENST00000477970 NSFP46459 744 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
PTPRF-212ENST00000477970 ACOT2P49753 483 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRF-212ENST00000477970 NOMO3P69849 1222 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRF-212ENST00000477970 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
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