RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476941.5

TRPC1-203, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 3,061 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-203ENST00000476941 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa20.36■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 STK24Q9Y6E0 443 aa20.36■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 SLC26A4O43511 780 aa20.36■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 VCAM1P19320 739 aa20.36■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 PPATQ06203 517 aa20.36■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 CPNE8Q86YQ8 564 aa20.36■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 BTBD6Q96KE9 485 aa20.36■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 LRRC37BQ96QE4 947 aa20.36■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 GPR88Q9GZN0 384 aa20.36■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 NMRK1Q9NWW6 199 aa20.36■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 CCPG1Q9ULG6 757 aa20.36■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 SORBS3O60504 671 aa20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 FTLP02792 175 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 ITGB5P18084 799 aa20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 PPP3CAQ08209 521 aa20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 IRGCQ6NXR0 463 aa20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 DAW1Q8N136 415 aa20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 MAGEB18Q96M61 343 aa20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 SERPINB12Q96P63 405 aa20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 SCN9AQ15858 1988 aa20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 PIK3CDO00329 1044 aa20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 NFIBO00712 420 aa20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 ANXA13P27216 316 aa20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 PPP2R5CQ13362 524 aa20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 DLGAP5Q15398 846 aa20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 CHURC1Q8WUH1 139 aa20.35■□□□□ 0.85
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TRPC1-203ENST00000476941 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
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TRPC1-203ENST00000476941 CALCAP01258 141 aa20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 ALAS1P13196 640 aa20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 KCNJ1P48048 391 aa20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 PPM1KQ8N3J5 372 aa20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 SLC30A5Q8TAD4 765 aa20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 FAM81AQ8TBF8 368 aa20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 LRRC8CQ8TDW0 803 aa20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 KRT35Q92764 455 aa20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 KIFC3Q9BVG8 833 aa20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 CHKBQ9Y259 395 aa20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 TMX2Q9Y320 296 aa20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 TAC1P20366 129 aa20.34■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 CALCOCO2Q13137 446 aa20.34■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 ACVR2BQ13705 512 aa20.34■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa20.34■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
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TRPC1-203ENST00000476941 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
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TRPC1-203ENST00000476941 TMEM253P0C7T8 217 aa20.34■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 FOXN2P32314 431 aa20.34■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 SP4Q02446 784 aa20.34■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 FOXB2Q5VYV0 432 aa20.34■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 NSMFQ6X4W1 530 aa20.34■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 GRAMD1AQ96CP6 724 aa20.34■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 AGPAT1Q99943 283 aa20.34■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 ALG6Q9Y672 507 aa20.34■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 WASHC2DQ5SRD0 308 aa20.33■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa20.33■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 ART4Q93070 314 aa20.33■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 FAM136AQ96C01 138 aa20.33■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 ZNF333Q96JL9 665 aa20.33■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 LMCD1Q9NZU5 365 aa20.33■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 COL20A1Q9P218 1284 aa20.33■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 PCYOX1Q9UHG3 505 aa20.33■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa20.33■□□□□ 0.85
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TRPC1-203ENST00000476941 PEX3P56589 373 aa20.33■□□□□ 0.84
TRPC1-203ENST00000476941 STRN3Q13033 797 aa20.33■□□□□ 0.84
TRPC1-203ENST00000476941 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
TRPC1-203ENST00000476941 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
TRPC1-203ENST00000476941 STOML1Q9UBI4 398 aa20.33■□□□□ 0.84
TRPC1-203ENST00000476941 LRCH1Q9Y2L9 728 aa20.33■□□□□ 0.84
TRPC1-203ENST00000476941 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa20.33■□□□□ 0.84
TRPC1-203ENST00000476941 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa20.33■□□□□ 0.84
TRPC1-203ENST00000476941 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa20.33■□□□□ 0.84
TRPC1-203ENST00000476941 VIL1P09327 827 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
TRPC1-203ENST00000476941 VAMP7P51809 220 aa20.33■□□□□ 0.84
TRPC1-203ENST00000476941 USP4Q13107 963 aa20.33■□□□□ 0.84
TRPC1-203ENST00000476941 OGFOD1Q8N543 542 aa20.33■□□□□ 0.84
TRPC1-203ENST00000476941 OLIG1Q8TAK6 271 aa20.33■□□□□ 0.84
TRPC1-203ENST00000476941 MAIP1Q8WWC4 291 aa20.33■□□□□ 0.84
TRPC1-203ENST00000476941 INPP5DQ92835 1189 aa20.33■□□□□ 0.84
TRPC1-203ENST00000476941 EHMT1Q9H9B1 1298 aa20.33■□□□□ 0.84
TRPC1-203ENST00000476941 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
TRPC1-203ENST00000476941 LTBP1Q14766 1721 aa20.33■□□□□ 0.84
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