RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 GALCP54803 685 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 GCNT1Q02742 428 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 TCEAL1Q15170 157 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 MARCH8Q5T0T0 291 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 RFFLQ8WZ73 363 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 KAT5Q92993 513 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 MINDY3Q9H8M7 445 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 FAM204AQ9H8W3 233 aa20.47■□□□□ 0.87
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SYF2-204ENST00000476231 WDR44Q5JSH3 913 aa20.46■□□□□ 0.87
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SYF2-204ENST00000476231 PKNOX2Q96KN3 472 aa20.46■□□□□ 0.87
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SYF2-204ENST00000476231 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 HLA-DRAP01903 254 aa20.46■□□□□ 0.87
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SYF2-204ENST00000476231 ZNF568Q3ZCX4 644 aa20.46■□□□□ 0.87
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SYF2-204ENST00000476231 WDR49Q8IV35 697 aa20.46■□□□□ 0.87
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SYF2-204ENST00000476231 AGPAT1Q99943 283 aa20.46■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.875e-6■□□□□ 8.9
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SYF2-204ENST00000476231 C1orf112Q9NSG2 853 aa20.46■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SYF2-204ENST00000476231 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SYF2-204ENST00000476231 B4GALT5O43286 388 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-204ENST00000476231 ALDH1A1P00352 501 aa20.45■□□□□ 0.86
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SYF2-204ENST00000476231 GLI1P08151 1106 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-204ENST00000476231 TNFSF9P41273 254 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-204ENST00000476231 PIK3CAP42336 1068 aa20.45■□□□□ 0.86
SYF2-204ENST00000476231 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
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SYF2-204ENST00000476231 ZNF410Q86VK4 478 aa20.45■□□□□ 0.86
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SYF2-204ENST00000476231 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
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SYF2-204ENST00000476231 ZSCAN26Q16670 478 aa20.44■□□□□ 0.86
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SYF2-204ENST00000476231 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa20.44■□□□□ 0.86
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SYF2-204ENST00000476231 TUBB8Q3ZCM7 444 aa20.43■□□□□ 0.86
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SYF2-204ENST00000476231 CDT1Q9H211 546 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-204ENST00000476231 CEP104O60308 925 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-204ENST00000476231 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-204ENST00000476231 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-204ENST00000476231 PPP2R5EQ16537 467 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-204ENST00000476231 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
SYF2-204ENST00000476231 CD302Q8IX05 232 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-204ENST00000476231 RHOT2Q8IXI1 618 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-204ENST00000476231 OR5B17Q8NGF7 314 aa20.43■□□□□ 0.86
SYF2-204ENST00000476231 EPS8L1Q8TE68 723 aa20.43■□□□□ 0.86
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