RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468031.1

NME4-210, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2

Gene NME4, Length 1,861 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-210ENST00000468031 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa20.09■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 MAATS1Q7Z4T9 603 aa20.09■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 ZBTB33Q86T24 672 aa20.09■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 MCOLN2Q8IZK6 566 aa20.09■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 MREGQ8N565 214 aa20.09■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 WHAMMQ8TF30 809 aa20.09■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 KATNBL1Q9H079 304 aa20.09■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 ZNF408Q9H9D4 720 aa20.09■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 NUB1Q9Y5A7 615 aa20.09■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa20.09■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 CCDC66A2RUB6 948 aa20.09■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 MAGEB2O15479 319 aa20.09■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 ITGA4P13612 1032 aa20.09■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 PEX5P50542 639 aa20.09■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 MBTD1Q05BQ5 628 aa20.09■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 ATF7IP2Q5U623 682 aa20.09■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 UBR7Q8N806 425 aa20.09■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 RNPEPQ9H4A4 650 aa20.09■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 NFU1Q9UMS0 254 aa20.09■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa20.09■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa20.08■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 FAM170AA1A519 330 aa20.08■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 SYF2O95926 243 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 POTEJP0CG39 1038 aa20.08■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 CLCN3P51790 818 aa20.08■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 FAM187BQ17R55 369 aa20.08■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 DUOXA2Q1HG44 320 aa20.08■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 LINC01465Q8N7H1 131 aa20.08■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 NLRP4Q96MN2 994 aa20.08■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 TNFSF13BQ9Y275 285 aa20.08■□□□□ 0.81
NME4-210ENST00000468031 ESYT3A0FGR9 886 aa20.07■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 GOLGA6BA6NDN3 693 aa20.07■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa20.07■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 INSRRP14616 1297 aa20.07■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 NSFP46459 744 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 ZNF132P52740 706 aa20.07■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 ALS2CLQ60I27 953 aa20.07■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 TMEM270Q6UE05 265 aa20.07■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 IFT81Q8WYA0 676 aa20.07■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 SEC14L1Q92503 715 aa20.07■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 KRT35Q92764 455 aa20.07■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 VCPIP1Q96JH7 1222 aa20.07■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa20.07■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 AGPSO00116 658 aa20.07■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 B4GALT4O60513 344 aa20.07■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 HOXC6P09630 235 aa20.07■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 GNA15P30679 374 aa20.07■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 PHKA2P46019 1235 aa20.07■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 GRB14Q14449 540 aa20.07■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa20.07■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 ZNF568Q3ZCX4 644 aa20.07■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 EXOC4Q96A65 974 aa20.07■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa20.07■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 UMODL1Q5DID0 1318 aa20.06■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 SPOPO43791 374 aa20.06■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 GGCXP38435 758 aa20.06■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 SEL1L2Q5TEA6 688 aa20.06■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 MON1BQ7L1V2 547 aa20.06■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 MTMR12Q9C0I1 747 aa20.06■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 PSD3Q9NYI0 1048 aa20.06■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 VPS18Q9P253 973 aa20.06■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 AMACRQ9UHK6 382 aa20.06■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 FAN1Q9Y2M0 1017 aa20.06■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 PPFIA4O75335 1185 aa20.05■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 IL18RAPO95256 599 aa20.05■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 CST3P01034 146 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 GJB1P08034 283 aa20.05■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 GPR142Q7Z601 462 aa20.05■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 AFG1LQ8WV93 481 aa20.05■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 NIF3L1Q9GZT8 377 aa20.05■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 IFT122Q9HBG6 1241 aa20.05■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 ADAM21Q9UKJ8 722 aa20.05■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 EVPLQ92817 2033 aa20.05■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 CALCAP01258 141 aa20.05■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 MARCKSL1P49006 195 aa20.05■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 NOMO3P69849 1222 aa20.05■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 FAM110CQ1W6H9 321 aa20.05■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 NAA35Q5VZE5 725 aa20.05■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 CYFIP2Q96F07 1278 aa20.05■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 C16orf70Q9BSU1 422 aa20.05■□□□□ 0.8
NME4-210ENST00000468031 CDT1Q9H211 546 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms