RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	19.28	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		19.28	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	FSD2	A1L4K1	749 aa		19.27	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	CLIC2	O15247	247 aa		19.27	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	EXTL3	O43909	919 aa		19.27	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	19.27	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		19.27	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	KLRC2	P26717	231 aa		19.27	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	19.27	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	19.27	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	19.27	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		19.27	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	19.27	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		19.27	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	19.27	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	GPD1L	Q8N335	351 aa		19.27	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		19.27	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	BEST2	Q8NFU1	509 aa		19.27	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	19.27	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	19.27	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	VWA8	A3KMH1	1905 aa		19.27	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902		I3L4J1	428 aa		19.26	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	TRAPPC3	O43617	180 aa		19.26	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	19.26	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	IL18RAP	O95256	599 aa		19.26	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	NFIC	P08651	508 aa		19.26	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	19.26	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	CYP2J2	P51589	502 aa		19.26	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	GUCY2F	P51841	1108 aa		19.26	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	19.26	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		19.26	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		19.26	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		19.26	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		19.26	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	ASB7	Q9H672	318 aa		19.26	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		19.26	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		19.26	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	19.26	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	IRAK3	Q9Y616	596 aa		19.26	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		19.25	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	19.25	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	TGFB1I1	O43294	461 aa		19.25	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	TBX10	O75333	385 aa		19.25	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	19.25	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	RHOBTB3	O94955	611 aa		19.25	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	SMC2	O95347	1197 aa		19.25	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	ADRB2	P07550	413 aa		19.25	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	19.25	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	LTBR	P36941	435 aa		19.25	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	BRCC3	P46736	316 aa		19.25	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	DSG1	Q02413	1049 aa		19.25	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	ZBTB6	Q15916	424 aa		19.25	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		19.25	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		19.25	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		19.25	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	19.25	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	RDH13	Q8NBN7	331 aa		19.25	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	19.25	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	TIGD1	Q96MW7	591 aa		19.25	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		19.25	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		19.25	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	CHST7	Q9NS84	486 aa		19.25	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		19.25	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	19.25	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		19.25	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	ZNF233	A6NK53	670 aa		19.24	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		19.24	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	KIF20A	O95235	890 aa		19.24	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	GLP2R	O95838	553 aa		19.24	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	EFEMP2	O95967	443 aa		19.24	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	CYP3A5	P20815	502 aa		19.24	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	MCM4	P33991	863 aa		19.24	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	19.24	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	19.24	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	KCNB1	Q14721	858 aa		19.24	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	RTP2	Q5QGT7	225 aa		19.24	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	SPATA1	Q5VX52	437 aa		19.24	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	19.24	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		19.24	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		19.24	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		19.24	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		19.24	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	19.24	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	SMARCE1	Q969G3	411 aa		19.24	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	RMND1	Q9NWS8	449 aa		19.24	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	DERA	Q9Y315	318 aa		19.24	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		19.24	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	SCN1A	P35498	2009 aa		19.24	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	C5orf42	Q9H799	3197 aa		19.23	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	PLXNA3	P51805	1871 aa		19.23	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	LILRB3	O75022	631 aa		19.23	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	ADH1A	P07327	375 aa		19.23	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	19.23	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	UBE2H	P62256	183 aa		19.23	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	19.23	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		19.23	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	19.23	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		19.23	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		19.23	■□□□□ 0.67
USP19-210	ENST00000465902	CASP10	Q92851	521 aa		19.23	■□□□□ 0.67

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