RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464168.5

USP4-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 4

Gene USP4, Length 601 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-208ENST00000464168 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa24.8■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 SLC38A7Q9NVC3 462 aa24.8■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 DNM3Q9UQ16 869 aa24.8■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 WDR27A2RRH5 827 aa24.79■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 PODXLO00592 558 aa24.79■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 ABLIM1O14639 778 aa24.79■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 KCNE1P15382 129 aa24.79■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 PTPN2P17706 415 aa24.79■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 PROZP22891 400 aa24.79■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 KIAA2013Q8IYS2 634 aa24.79■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 RUSC1Q9BVN2 902 aa24.79■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 LTB4R2Q9NPC1 389 aa24.79■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.79■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa24.79■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 STK24Q9Y6E0 443 aa24.79■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 PP2D1A8MPX8 630 aa24.78■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 MCF2P10911 925 aa24.78■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 ATF2P15336 505 aa24.78■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 CEBPBP17676 345 aa24.78■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP24.78■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 MAPK7Q13164 816 aa24.78■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 IL17AQ16552 155 aa24.78■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 ZNF528Q3MIS6 628 aa24.78■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 SUMF1Q8NBK3 374 aa24.78■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 RUBCNQ92622 972 aa24.78■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 RMDN1Q96DB5 314 aa24.78■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 ACAP3Q96P50 834 aa24.78■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 KMT5AQ9NQR1 393 aa24.78■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 FBXO4Q9UKT5 387 aa24.78■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 FANCMQ8IYD8 2048 aa24.78■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 PRRG1O14668 218 aa24.77■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 SYN3O14994 580 aa24.77■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 LAMTOR5O43504 91 aa24.77■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 SEC24AO95486 1093 aa24.77■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 LRG1P02750 347 aa24.77■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 CDC25AP30304 524 aa24.77■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 ELF1P32519 619 aa24.77■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 TANGO2Q6ICL3 276 aa24.77■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 RINT1Q6NUQ1 792 aa24.77■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 C1orf186Q6ZWK4 172 aa24.77■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 KCNK18Q7Z418 384 aa24.77■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 TCEAL8Q8IYN2 117 aa24.77■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 FAM184AQ8NB25 1140 aa24.77■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 DRC1Q96MC2 740 aa24.77■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 TCHPQ9BT92 498 aa24.77■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 RAB34Q9BZG1 259 aa24.77■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 CNTN3Q9P232 1028 aa24.77■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 NCOR2Q9Y618 2525 aa24.77■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 F5P12259 2224 aa24.77■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 RPL9P32969 192 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 ARPP19P56211 112 aa24.76■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 PRSS36Q5K4E3 855 aa24.76■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa24.76■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 KRT79Q5XKE5 535 aa24.76■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 MPZL3Q6UWV2 235 aa24.76■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 TPRG1Q6ZUI0 275 aa24.76■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 DCLK2Q8N568 766 aa24.76■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 CLDN23Q96B33 292 aa24.76■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 TCEAL4Q96EI5 215 aa24.76■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 CORO1BQ9BR76 489 aa24.76■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 CYP4F11Q9HBI6 524 aa24.76■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 FBXL5Q9UKA1 691 aa24.76■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 SHISA7A6NL88 538 aa24.75■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 SFI1A8K8P3 1242 aa24.75■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 SLC16A4O15374 487 aa24.75■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 TARSP26639 723 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 ELSPBP1Q96BH3 223 aa24.75■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 NELL2Q99435 816 aa24.75■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 HINFPQ9BQA5 517 aa24.75■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 C17orf75Q9HAS0 396 aa24.75■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 NUB1Q9Y5A7 615 aa24.75■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 MIA3Q5JRA6 1907 aa24.74■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 H7C4K7 107 aa24.74■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 KINO60870 393 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 FCARP24071 287 aa24.74■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 MAGEA9P43362 315 aa24.74■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 FZD5Q13467 585 aa24.74■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 TPGS2Q68CL5 300 aa24.74■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 SUSD3Q96L08 255 aa24.74■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 HEBP1Q9NRV9 189 aa24.74■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 INSL5Q9Y5Q6 135 aa24.74■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 LAD1O00515 517 aa24.73■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 MICAL2O94851 1124 aa24.73■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 HARSP12081 509 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
USP4-208ENST00000464168 CCR2P41597 374 aa24.73■■□□□ 1.55
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