RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 PTPRAP18433 802 aa21.83■■□□□ 1.08
IMP4-208ENST00000460766 CHADLQ6NUI6 762 aa21.83■■□□□ 1.08
IMP4-208ENST00000460766 TMEM109Q9BVC6 243 aa21.83■■□□□ 1.08
IMP4-208ENST00000460766 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
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IMP4-208ENST00000460766 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
IMP4-208ENST00000460766 WHRNQ9P202 907 aa21.83■■□□□ 1.08
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IMP4-208ENST00000460766 CCDC38Q502W7 563 aa21.82■■□□□ 1.08
IMP4-208ENST00000460766 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa21.82■■□□□ 1.08
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IMP4-208ENST00000460766 C11orf70Q9BRQ4 267 aa21.82■■□□□ 1.08
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IMP4-208ENST00000460766 DCAF15Q66K64 600 aa21.82■■□□□ 1.08
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IMP4-208ENST00000460766 MAIP1Q8WWC4 291 aa21.82■■□□□ 1.08
IMP4-208ENST00000460766 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
IMP4-208ENST00000460766 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
IMP4-208ENST00000460766 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
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IMP4-208ENST00000460766 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa21.81■■□□□ 1.08
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IMP4-208ENST00000460766 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
IMP4-208ENST00000460766 CHKAP35790 457 aa21.81■■□□□ 1.08
IMP4-208ENST00000460766 LONRF1Q17RB8 773 aa21.81■■□□□ 1.08
IMP4-208ENST00000460766 MON1BQ7L1V2 547 aa21.81■■□□□ 1.08
IMP4-208ENST00000460766 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
IMP4-208ENST00000460766 SNF8Q96H20 258 aa21.81■■□□□ 1.08
IMP4-208ENST00000460766 ACAD9Q9H845 621 aa21.81■■□□□ 1.08
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IMP4-208ENST00000460766 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa21.81■■□□□ 1.08
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IMP4-208ENST00000460766 ITGA8P53708 1063 aa21.8■■□□□ 1.08
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IMP4-208ENST00000460766 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
IMP4-208ENST00000460766 ATF2P15336 505 aa21.79■■□□□ 1.08
IMP4-208ENST00000460766 ATP4AP20648 1035 aa21.79■■□□□ 1.08
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IMP4-208ENST00000460766 ADCY8P40145 1251 aa21.79■■□□□ 1.08
IMP4-208ENST00000460766 PTK6Q13882 451 aa21.79■■□□□ 1.08
IMP4-208ENST00000460766 KCNV1Q6PIU1 500 aa21.79■■□□□ 1.08
IMP4-208ENST00000460766 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
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