RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	DSC1	Q08554	894 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZBTB6	Q15916	424 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	SPRED2	Q7Z698	418 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF558	Q96NG5	402 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	THAP9	Q9H5L6	903 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	INTS13	Q9NVM9	706 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	FANCL	Q9NW38	375 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	DPP3	Q9NY33	737 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	14.81	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	PTPRJ	Q12913	1337 aa		14.81	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	SMTNL1	A8MU46	457 aa		14.81	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	PHACTR2	O75167	634 aa		14.81	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	CLSTN1	O94985	981 aa		14.81	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	CYP3A5	P20815	502 aa		14.81	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	14.81	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC11A1	P49279	550 aa		14.81	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	BIRC3	Q13489	604 aa		14.81	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	HASPIN	Q8TF76	798 aa		14.81	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	BORCS6	Q96GS4	357 aa		14.81	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	UROC1	Q96N76	676 aa		14.81	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		14.81	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		14.81	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		14.81	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		14.81	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	PODXL	O00592	558 aa		14.8	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	IKBKB	O14920	756 aa		14.8	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	TADA2A	O75478	443 aa		14.8	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	B3GAT3	O94766	335 aa		14.8	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	ITGB3	P05106	788 aa		14.8	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	14.8	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	BMPR1A	P36894	532 aa		14.8	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	GCLM	P48507	274 aa		14.8	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	UPP1	Q16831	310 aa		14.8	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	EPC2	Q52LR7	807 aa		14.8	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	14.8	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		14.8	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF516	Q92618	1163 aa		14.8	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	14.8	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	CBX8	Q9HC52	389 aa		14.8	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	ANK1	P16157	1881 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	KCNJ18	B7U540	433 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402		F8W810	466 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	14.79	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	STX10	O60499	249 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	CAVIN2	O95810	425 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	AP3M2	P53677	418 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF445	P59923	1031 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	KCNJ12	Q14500	433 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	LUZP1	Q86V48	1076 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	LRCH3	Q96II8	777 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	SPG21	Q9NZD8	308 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	14.79	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	14.79	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIF4A	O95239	1232 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	LINC00271	P0C7V0	271 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	ERVK-21	P61565	698 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	CLDN10	P78369	228 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRT17	Q04695	432 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	PPP3CA	Q08209	521 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRPC3	Q13507	836 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	NCAPH	Q15003	741 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM169	Q96HH4	297 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGSF21	Q96ID5	467 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	SAMD11	Q96NU1	681 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF576	Q9H609	170 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	CARNS1	A5YM72	827 aa		14.77	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		14.77	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	PPEF2	O14830	753 aa		14.77	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	FGF18	O76093	207 aa		14.77	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	CSPG5	O95196	566 aa		14.77	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.04

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