RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439986.8

CCBE1-202, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCBE1, Length 6,227 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-202ENST00000439986 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 CDKAL1Q5VV42 579 aa12.2□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 TTC25Q96NG3 672 aa12.2□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 LACRTQ9GZZ8 138 aa12.2□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM206Q9H813 350 aa12.2□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 ABCB11O95342 1321 aa12.2□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 MYOM1P52179 1685 aa12.2□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 ZBTB39O15060 712 aa12.2□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 CSF1RP07333 972 aa12.2□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa12.2□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 LUZP2Q86TE4 346 aa12.2□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 FBXO41Q8TF61 875 aa12.2□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 C7orf25Q9BPX7 421 aa12.2□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM191CA6NGB0 347 aa12.2□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 TTI1O43156 1089 aa12.2□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 SDE2Q6IQ49 451 aa12.2□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 KRT73Q86Y46 540 aa12.2□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF507Q8TCN5 953 aa12.2□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 CENPTQ96BT3 561 aa12.2□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 CYFIP2Q96F07 1278 aa12.2□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 WDR11Q9BZH6 1224 aa12.2□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 GTSE1Q9NYZ3 720 aa12.2□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 MAFFQ9ULX9 164 aa12.2□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 A0A1B0GW55 424 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 USP17L15C9J2P7 530 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 RASA4BC9J798 803 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 USP17L13C9JLJ4 530 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 USP17L11C9JVI0 530 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 USP17L18D6R9N7 530 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 USP17L22D6RA61 530 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 USP17L17D6RBQ6 530 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 USP17L19D6RCP7 530 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 USP17L20D6RJB6 530 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 RASA4O43374 803 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 FAM107AO95990 144 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 TFRCP02786 760 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 DUX4L2P0CJ85 424 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 DUX4L3P0CJ86 424 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 DUX4L4P0CJ87 422 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 DUX4L5P0CJ88 424 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 DUX4L6P0CJ89 424 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 DUX4L7P0CJ90 424 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 USP17L24Q0WX57 530 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 RBBP7Q16576 425 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 USP17L6PQ6QN14 398 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 LRIG3Q6UXM1 1119 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 KDELC2Q7Z4H8 507 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 YIPF3Q9GZM5 350 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 DUX4Q9UBX2 424 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 HEY1Q9Y5J3 304 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 A0A1W2PQJ5 194 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 MAP3K7O43318 606 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 TMCC1O94876 653 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 HSPA4LO95757 839 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 VIL1P09327 827 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 BRAFP15056 766 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 PAMP19021 973 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 CHRNA3P32297 505 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 PTGISQ16647 500 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 ARMC3Q5W041 872 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 KRT80Q6KB66 452 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 HPS4Q9NQG7 708 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 SLC8A2Q9UPR5 921 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 A0A0G2JND7 137 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 CFAP73A6NFT4 308 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 FAM187AA6NFU0 413 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 FAM196BA6NMK8 535 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 ANP32DO95626 131 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 CPEP16870 476 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 COTL1Q14019 142 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 ACCSLQ4AC99 568 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 RFX8Q6ZV50 586 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 IFT43Q96FT9 208 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 CEP95Q96GE4 821 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 CENPKQ9BS16 269 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 FAM167BQ9BTA0 163 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM60Q9H2L4 133 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 ETNK1Q9HBU6 452 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 ATG16L1Q676U5 607 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 POTEGQ6S5H5 508 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 KRT77Q7Z794 578 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 ARL8AQ96BM9 186 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 OLFM3Q96PB7 478 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 CCDC90BQ9GZT6 254 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 CHMP2BQ9UQN3 213 aa12.19□□□□□ -0.46
CCBE1-202ENST00000439986 VWDEQ8N2E2 1590 aa12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms