RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439083.5

TNS1-208, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 5

Gene TNS1, Length 538 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-208ENST00000439083 ZNF461Q8TAF7 563 aa15.77■□□□□ 0.12
TNS1-208ENST00000439083 SLC7A14Q8TBB6 771 aa15.77■□□□□ 0.12
TNS1-208ENST00000439083 RSAD2Q8WXG1 361 aa15.77■□□□□ 0.12
TNS1-208ENST00000439083 TSPAN18Q96SJ8 248 aa15.77■□□□□ 0.12
TNS1-208ENST00000439083 KCNH3Q9ULD8 1083 aa15.77■□□□□ 0.12
TNS1-208ENST00000439083 NUB1Q9Y5A7 615 aa15.77■□□□□ 0.12
TNS1-208ENST00000439083 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 TBC1D4O60343 1298 aa15.76■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 ABLIM3O94929 683 aa15.76■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 PIGRP01833 764 aa15.76■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 GPBP1Q86WP2 473 aa15.76■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 SIX5Q8N196 739 aa15.76■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 FLCNQ8NFG4 579 aa15.76■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 SUSD3Q96L08 255 aa15.76■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 REEP2Q9BRK0 252 aa15.76■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 CCSER1Q9C0I3 900 aa15.76■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 PARVGQ9HBI0 331 aa15.76■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa15.76■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa15.76■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa15.76■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 MAFFQ9ULX9 164 aa15.76■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 TTC26A0AVF1 554 aa15.75■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 ARHGEF37A1IGU5 675 aa15.75■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 PROB1E7EW31 1015 aa15.75■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 H0Y858 1186 aa15.75■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 I3L4J1 428 aa15.75■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 CCL16O15467 120 aa15.75■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 STX6O43752 255 aa15.75■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 NARSO43776 548 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 HARSP12081 509 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 ATF2P15336 505 aa15.75■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 CYP3A5P20815 502 aa15.75■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 ZBTB6Q15916 424 aa15.75■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 TPGS2Q68CL5 300 aa15.75■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 MTSS1LQ765P7 747 aa15.75■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 APPL2Q8NEU8 664 aa15.75■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 RASSF8Q8NHQ8 419 aa15.75■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 FGF13Q92913 245 aa15.75■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 PHOX2BQ99453 314 aa15.75■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 TBX20Q9UMR3 447 aa15.75■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 POLIQ9UNA4 740 aa15.75■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa15.74■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 TRAK2O60296 914 aa15.74■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 FAM13AO94988 1023 aa15.74■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 ADRB2P07550 413 aa15.74■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 CFHP08603 1231 aa15.74■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 PLCG1P19174 1290 aa15.74■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 PAX3P23760 479 aa15.74■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 LRPAP1P30533 357 aa15.74■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 ELF1P32519 619 aa15.74■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 DDIT3P35638 169 aa15.74■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 LIG4P49917 911 aa15.74■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 NTHL1P78549 312 aa15.74■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 ROR1Q01973 937 aa15.74■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa15.74■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 TCEAL8Q8IYN2 117 aa15.74■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 MYCT1Q8N699 235 aa15.74■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 RAD54LQ92698 747 aa15.74■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 BICD1Q96G01 975 aa15.74■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 CCDC39Q9UFE4 941 aa15.74■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 NUMBLQ9Y6R0 609 aa15.74■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 DOCK8Q8NF50 2099 aa15.73■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 KRBA1A5PL33 1030 aa15.73■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 OGTO15294 1046 aa15.73■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 XPOTO43592 962 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 TXLNAP40222 546 aa15.73■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP15.73■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 KARSQ15046 597 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 SEZ6Q53EL9 994 aa15.73■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 CD302Q8IX05 232 aa15.73■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 CCDC105Q8IYK2 499 aa15.73■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 LRRC15Q8TF66 581 aa15.73■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 HAPLN2Q9GZV7 340 aa15.73■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa15.73■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 GDE1Q9NZC3 331 aa15.73■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 FBXL5Q9UKA1 691 aa15.73■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 PCDHB8Q9UN66 801 aa15.73■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 VWA8A3KMH1 1905 aa15.72■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 A0A0B4J269 797 aa15.72■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 WDR27A2RRH5 827 aa15.72■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 M0QZQ0 153 aa15.72■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 PRRG1O14668 218 aa15.72■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 PI15O43692 258 aa15.72■□□□□ 0.11
TNS1-208ENST00000439083 FAM189A1O60320 539 aa15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms