RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436996.1

TTC28-AS1-215, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GLYCTKQ8IVS8 523 aa10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SPATA20Q8TB22 786 aa10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EEF2KMTQ96G04 330 aa10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MTMR12Q9C0I1 747 aa10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LMAN2LQ9H0V9 348 aa10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KANSL3Q9P2N6 904 aa10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PATJQ8NI35 1801 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 H3BQ06 376 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SPTLC1O15269 473 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EXTL3O43909 919 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SOD2P04179 222 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MYL1P05976 194 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CTSAP10619 480 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LTBRP36941 435 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KCNQ1P51787 676 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 UBE3AQ05086 875 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMEM132DQ14C87 1099 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZBTB6Q15916 424 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PTPROQ16827 1216 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DUSP6Q16828 381 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZCWPW2Q504Y3 356 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KANK3Q6NY19 840 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMC7Q7Z402 723 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GPD1LQ8N335 351 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RDH13Q8NBN7 331 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OR5B17Q8NGF7 314 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SMARCE1Q969G3 411 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TIGD1Q96MW7 591 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 APOL5Q9BWW9 433 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMEM206Q9H813 350 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KCNG1Q9UIX4 513 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LZTS1Q9Y250 596 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BDP1A6H8Y1 2624 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MYO10Q9HD67 2058 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LILRB3O75022 631 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 B3GAT3O94766 335 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NR3C1P04150 777 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EPCAMP16422 314 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SCP2P22307 547 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PRCPP42785 496 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GLUD2P49448 558 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CDR1P51861 262 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CYP24A1Q07973 514 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C9orf57Q5W0N0 161 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLFN12LQ6IEE8 588 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EP400NLQ6ZTU2 488 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C1orf127Q8N9H9 656 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CXorf38Q8TB03 319 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RSPH1Q8WYR4 309 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FBXL18Q96ME1 805 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CLSTN2Q9H4D0 955 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CLDND1Q9NY35 253 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LMCD1Q9NZU5 365 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SIX4Q9UIU6 781 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CTNND2Q9UQB3 1225 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP10.21□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRIOO75962 3097 aa10.21□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HCRTO43612 131 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TADA2AO75478 443 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CXCL14O95715 111 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ALDH2P05091 517 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-215ENST00000436996 URODP06132 367 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CNPP09543 421 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRIM49P0CI25 452 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRIM49CP0CI26 452 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KCNA5P22460 613 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LRPAP1P30533 357 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-215ENST00000436996 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ABCD1P33897 745 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MCM4P33991 863 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DLG4P78352 724 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DSG1Q02413 1049 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MORC3Q14149 939 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-215ENST00000436996 COL19A1Q14993 1142 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CCDC142Q17RM4 750 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C1orf220Q5T0J3 134 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM171A1Q5VUB5 890 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KIAA0319Q5VV43 1072 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SPATA1Q5VX52 437 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KLHL10Q6JEL2 608 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CEP57Q86XR8 500 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C12orf56Q8IXR9 622 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-215ENST00000436996 XXYLT1Q8NBI6 393 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms