RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433317.1

TTC28-AS1-212, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 3,080 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TATDN1Q6P1N9 297 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GRAMD1AQ96CP6 724 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KIFC3Q9BVG8 833 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SAYSD1Q9NPB0 183 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 USTQ9Y2C2 406 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GM2AP17900 193 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KRT15P19012 456 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 EPHB2P29323 1055 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MAGEA4P43358 317 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 BLMHQ13867 455 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 STAT4Q14765 748 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ARMC2Q8NEN0 867 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NT5C1BQ96P26 610 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KLHL11Q9NVR0 708 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GRIN3BO60391 1043 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CD58P19256 250 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MAN1A1P33908 653 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CCDC15Q0P6D6 951 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KRT39Q6A163 491 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LONP2Q86WA8 852 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SP8Q8IXZ3 490 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FAM13CQ8NE31 585 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KIFAP3Q92845 792 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GRID1Q9ULK0 1009 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SIPA1L1O43166 1804 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PEX11AO75192 247 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ASMTLO95671 621 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PDHA1P08559 390 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SATB1Q01826 763 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GRIK3Q13003 919 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MAIP1Q8WWC4 291 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MAML1Q92585 1016 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 C8orf37Q96NL8 207 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NUDCD1Q96RS6 583 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LRMDAQ9H2I8 198 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 USH1CQ9Y6N9 552 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MAPK13O15264 365 aa15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PLS3P13797 630 aa15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PCK1P35558 622 aa15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GLIS1Q8NBF1 620 aa15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TTC8Q8TAM2 541 aa15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TRABDQ9H4I3 376 aa15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZHX2Q9Y6X8 837 aa15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CALB2P22676 271 aa15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KAZNQ674X7 775 aa15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TRABD2AQ86V40 505 aa15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CCDC89Q8N998 374 aa15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ACER1Q8TDN7 264 aa15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZDHHC15Q96MV8 337 aa15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KIAA1586Q9HCI6 787 aa15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 EURLQ9NYK6 297 aa15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 STARD13Q9Y3M8 1113 aa15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 WFS1O76024 890 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GNAZP19086 355 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CA4P22748 312 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GCAP28676 217 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ADSSP30520 456 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SPARCL1Q14515 664 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PCNX4Q63HM2 1172 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PASD1Q8IV76 773 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MCOLN2Q8IZK6 566 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ENTPD5O75356 428 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 VIL1P09327 827 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MYBL1P10243 752 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RARRES1P49788 294 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 YARSP54577 528 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TAS2R40P59535 323 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FBXL13Q8NEE6 735 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LRRC8CQ8TDW0 803 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PARD3BQ8TEW8 1205 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 VPS37BQ9H9H4 285 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RAB20Q9NX57 234 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CYP39A1Q9NYL5 469 aa15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms