RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429751.6

RRN3-203, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,198 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-203ENST00000429751 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 HOMER3Q9NSC5 361 aa8.71□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 POTEFA5A3E0 1075 aa8.7□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 O00370 1275 aa8.7□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 PEX10O60683 326 aa8.7□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 SUN1O94901 812 aa8.7□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 GGPS1O95749 300 aa8.7□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 IGHA2P01877 340 aa8.7□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 RARGP13631 454 aa8.7□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 CTNNA2P26232 953 aa8.7□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 CALRP27797 417 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 UBXN2AP68543 259 aa8.7□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 PRKCZQ05513 592 aa8.7□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 BNIP1Q12981 228 aa8.7□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 GNPTABQ3T906 1256 aa8.7□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 USP17L6PQ6QN14 398 aa8.7□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 POTEGQ6S5H5 508 aa8.7□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 NLRX1Q86UT6 975 aa8.7□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 SLFN12Q8IYM2 578 aa8.7□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 ARHGEF26Q96DR7 871 aa8.7□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 IFT74Q96LB3 600 aa8.7□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 ZNF570Q96NI8 536 aa8.7□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 RUNDC3BQ96NL0 473 aa8.7□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 TAAR1Q96RJ0 339 aa8.7□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 PLCD4Q9BRC7 762 aa8.7□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 PDCD2LQ9BRP1 358 aa8.7□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa8.7□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 ARHGEF3Q9NR81 526 aa8.7□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa8.7□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 ANKRD62A6NC57 917 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 SOWAHBA6NEL2 793 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 ADCY3O60266 1144 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 GJB6O95452 261 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 NR3C2P08235 984 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 TGFB3P10600 412 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 CYP2B6P20813 491 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 FGFR4P22455 802 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 CIITAP33076 1130 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 SLCO1A2P46721 670 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 GRIK3Q13003 919 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 PGM5Q15124 567 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 C11orf63Q6NUN7 778 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 EXOC3L1Q86VI1 746 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 VSIG10LQ86VR7 867 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 CATSPER3Q86XQ3 398 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 RHOT2Q8IXI1 618 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 UBL4BQ8N7F7 174 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 PRELID2Q8N945 189 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 DYDC1Q8WWB3 177 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 ART4Q93070 314 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 KLHL29Q96CT2 875 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 GPRASP2Q96D09 838 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 BORCS6Q96GS4 357 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 MBOAT7Q96N66 472 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 CCDC113Q9H0I3 377 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 THAP2Q9H0W7 228 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 SLC24A3Q9HC58 644 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 DNAJC12Q9UKB3 198 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 COG5Q9UP83 839 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 DNM3Q9UQ16 869 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 MCM3APO60318 1980 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 TCP11X1B4DZS4 312 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 MSCO60682 206 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 DIAPH2O60879 1101 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 PGK2P07205 417 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 KRT16P08779 473 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 TNFAIP3P21580 790 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 CYP3A7P24462 503 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 GRK4P32298 578 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 CNTN2Q02246 1040 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 TTC27Q6P3X3 843 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 ASRGL1Q7L266 308 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 ARMCX2Q7L311 632 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 CYFIP1Q7L576 1253 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 ERMNQ8TAM6 284 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 NPLOC4Q8TAT6 608 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 GPR88Q9GZN0 384 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 RXFP1Q9HBX9 757 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 COL20A1Q9P218 1284 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 GABRQQ9UN88 632 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 ALG6Q9Y672 507 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 CLIC2O15247 247 aa8.68□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 GCNT3O95395 438 aa8.68□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 RPA1P27694 616 aa8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms