RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 SEPT2Q15019 361 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-208ENST00000427110 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
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PTPRC-208ENST00000427110 ATAT1Q5SQI0 421 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-208ENST00000427110 LAIR1Q6GTX8 287 aa3.12□□□□□ -1.91
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PTPRC-208ENST00000427110 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
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PTPRC-208ENST00000427110 ULK2Q8IYT8 1036 aa3.1□□□□□ -1.91
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