RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414069.2

SPRN-201, Transcript of shadow of prion protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPRN, Length 3,128 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRN-201ENST00000414069 CCT8L2Q96SF2 557 aa22.22■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 ADM5C9JUS6 153 aa22.22■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 PTENP60484 403 aa22.22■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 MYO1EQ12965 1108 aa22.22■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 FOXO6A8MYZ6 492 aa22.21■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 MAPK4P31152 587 aa22.21■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 RPL21P46778 160 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 CDR2Q01850 454 aa22.21■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 OTUD5Q96G74 571 aa22.21■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 ERP44Q9BS26 406 aa22.21■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.21■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 BTBD7Q9P203 1132 aa22.21■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 RARAP10276 462 aa22.21■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 GLRA2P23416 452 aa22.21■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.21■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.21■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 LRRC45Q96CN5 670 aa22.21■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 YIPF3Q9GZM5 350 aa22.21■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa22.21■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa22.21■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa22.2■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 VGLL4Q14135 290 aa22.2■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 MYBPC2Q14324 1141 aa22.2■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 STXBP2Q15833 593 aa22.2■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.2■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 HERPUD2Q9BSE4 406 aa22.2■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 CES2O00748 559 aa22.2■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 CCDC38Q502W7 563 aa22.2■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 FUKQ8N0W3 1084 aa22.2■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.2■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 RUBCNQ92622 972 aa22.2■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 KLHL33A6NCF5 533 aa22.2■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 ORC1Q13415 861 aa22.2■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 TMEM132AQ24JP5 1023 aa22.2■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 WDR44Q5JSH3 913 aa22.2■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa22.2■■□□□ 1.14
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SPRN-201ENST00000414069 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.2■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 SEMA4AQ9H3S1 761 aa22.2■■□□□ 1.14
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SPRN-201ENST00000414069 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 PPP1R7Q15435 360 aa22.19■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 ELP3Q9H9T3 547 aa22.19■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.19■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 DNM1LO00429 736 aa22.19■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 GPC3P51654 580 aa22.19■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 ADCY1Q08828 1119 aa22.19■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 NLRP14Q86W24 1093 aa22.19■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.19■■□□□ 1.14
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SPRN-201ENST00000414069 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa22.18■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 MFSD14AQ96MC6 490 aa22.18■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 CHST7Q9NS84 486 aa22.18■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.18■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
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SPRN-201ENST00000414069 PSME4Q14997 1843 aa22.18■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 H0YGN5 161 aa22.18■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 RFX1P22670 979 aa22.18■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 PSMC4P43686 418 aa22.18■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa22.18■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.18■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 COPS5Q92905 334 aa22.18■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa22.18■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 NFS1Q9Y697 457 aa22.18■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 IGBP1P78318 339 aa22.17■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 GRIK3Q13003 919 aa22.17■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 SLC29A2Q14542 456 aa22.17■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa22.17■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 RAB17Q9H0T7 212 aa22.17■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 PNMA2Q9UL42 364 aa22.17■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 L3MBTL1Q9Y468 752 aa22.17■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.17■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 FZD9O00144 591 aa22.17■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 GRIN3BO60391 1043 aa22.17■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 GGPS1O95749 300 aa22.17■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 OATP04181 439 aa22.17■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 THNSL1Q8IYQ7 743 aa22.17■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 NSMCE1Q8WV22 266 aa22.17■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa22.17■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 CST3P01034 146 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SPRN-201ENST00000414069 MREGQ8N565 214 aa22.17■■□□□ 1.14
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