RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 PSMA7O14818 248 aa22.56■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 GARTP22102 1010 aa22.56■■□□□ 1.2
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C4orf48-201ENST00000409248 ADAM15Q13444 863 aa22.56■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
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C4orf48-201ENST00000409248 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa22.56■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 MLKLQ8NB16 471 aa22.56■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 RABGGTAQ92696 567 aa22.56■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa22.56■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 DACH1Q9UI36 760 aa22.56■■□□□ 1.2
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C4orf48-201ENST00000409248 B3GAT3O94766 335 aa22.55■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 EFEMP2O95967 443 aa22.55■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 UPP1Q16831 310 aa22.55■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 USP41Q3LFD5 358 aa22.55■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 LEXMQ3ZCV2 418 aa22.55■■□□□ 1.2
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C4orf48-201ENST00000409248 KIF12Q96FN5 646 aa22.55■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 IKZF4Q9H2S9 585 aa22.55■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.55■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa22.55■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa22.55■■□□□ 1.2
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C4orf48-201ENST00000409248 LINC01565O15544 149 aa22.54■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 TGFB1I1O43294 461 aa22.54■■□□□ 1.2
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C4orf48-201ENST00000409248 TBX10O75333 385 aa22.54■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 LDHAP00338 332 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 ADSSP30520 456 aa22.54■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 RPL9P32969 192 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 ACOT2P49753 483 aa22.54■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 CLCNKBP51801 687 aa22.54■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 DSG1Q02413 1049 aa22.54■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 CREMQ03060 361 aa22.54■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 STX1AQ16623 288 aa22.54■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 KLHL10Q6JEL2 608 aa22.54■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 GPR65Q8IYL9 337 aa22.54■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 FAM212AQ96EL1 285 aa22.54■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 TSG101Q99816 390 aa22.54■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 GPR62Q9BZJ7 368 aa22.54■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 ANO10Q9NW15 660 aa22.54■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 LACTBL1A8MY62 500 aa22.53■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.53■■□□□ 1.2
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C4orf48-201ENST00000409248 PODXLO00592 558 aa22.53■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 TRAPPC3O43617 180 aa22.53■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 ADRB2P07550 413 aa22.53■■□□□ 1.2
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C4orf48-201ENST00000409248 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22.53■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 ASB7Q9H672 318 aa22.53■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.21e-6■■■□□ 15.3
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C4orf48-201ENST00000409248 CTNND2Q9UQB3 1225 aa22.53■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 FAM50BQ9Y247 325 aa22.53■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 DERAQ9Y315 318 aa22.53■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 SYCE3A1L190 88 aa22.52■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 C2CD2LO14523 706 aa22.52■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 IL18RAPO95256 599 aa22.52■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 GLP2RO95838 553 aa22.52■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 CYP3A5P20815 502 aa22.52■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 CCNE1P24864 410 aa22.52■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 LTBRP36941 435 aa22.52■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 PAK1Q13153 545 aa22.52■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 TMEM132DQ14C87 1099 aa22.52■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.52■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 PDXDC1Q6P996 788 aa22.52■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.52■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 NELFBQ8WX92 580 aa22.52■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 CASP10Q92851 521 aa22.52■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 CBWD1Q9BRT8 395 aa22.52■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 FAM213AQ9BRX8 229 aa22.52■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa22.52■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.52■■□□□ 1.2
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C4orf48-201ENST00000409248 CLIC2O15247 247 aa22.51■■□□□ 1.19
C4orf48-201ENST00000409248 EXTL3O43909 919 aa22.51■■□□□ 1.19
C4orf48-201ENST00000409248 ADH1AP07327 375 aa22.51■■□□□ 1.19
C4orf48-201ENST00000409248 CCDC192P0DO97 292 aa22.51■■□□□ 1.19
C4orf48-201ENST00000409248 KCNQ1P51787 676 aa22.51■■□□□ 1.19
C4orf48-201ENST00000409248 LRRC63Q05C16 580 aa22.51■■□□□ 1.19
C4orf48-201ENST00000409248 TYRO3Q06418 890 aa22.51■■□□□ 1.19
C4orf48-201ENST00000409248 SPAG1Q07617 926 aa22.51■■□□□ 1.19
C4orf48-201ENST00000409248 FAM171A1Q5VUB5 890 aa22.51■■□□□ 1.19
C4orf48-201ENST00000409248 KIAA0319Q5VV43 1072 aa22.51■■□□□ 1.19
C4orf48-201ENST00000409248 CENPPQ6IPU0 288 aa22.51■■□□□ 1.19
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