RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 NT5DC1Q5TFE4 455 aa13.53□□□□□ -0.24
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PRAME-204ENST00000403441 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
PRAME-204ENST00000403441 IGSF22Q8N9C0 903 aa13.53□□□□□ -0.24
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PRAME-204ENST00000403441 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
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PRAME-204ENST00000403441 ADCY1Q08828 1119 aa13.5□□□□□ -0.25
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PRAME-204ENST00000403441 SNX29Q8TEQ0 813 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 ACAP3Q96P50 834 aa13.5□□□□□ -0.25
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PRAME-204ENST00000403441 POLD4Q9HCU8 107 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 KMT5AQ9NQR1 393 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 HEBP1Q9NRV9 189 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 DNM3Q9UQ16 869 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 INSL5Q9Y5Q6 135 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 NOTCH4Q99466 2003 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 NCOR2Q9Y618 2525 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 H3BQV1 296 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 MAN2B1O00754 1011 aa13.49□□□□□ -0.25
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