RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393503.2

CNGA3-202, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene CNGA3, Length 569 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-202ENST00000393503 VNN2O95498 520 aa14.58□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 ID4P47928 161 aa14.58□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 UVSSAQ2YD98 709 aa14.58□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF568Q3ZCX4 644 aa14.58□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 HAUS3Q68CZ6 603 aa14.58□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 RINT1Q6NUQ1 792 aa14.58□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 SNX29Q8TEQ0 813 aa14.58□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 LRRC15Q8TF66 581 aa14.58□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 IFT74Q96LB3 600 aa14.58□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 ZSWIM3Q96MP5 696 aa14.58□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 PPP4R2Q9NY27 417 aa14.58□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 KCNH3Q9ULD8 1083 aa14.58□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa14.58□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 COL4A2P08572 1712 aa14.58□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 PATJQ8NI35 1801 aa14.57□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 SLC16A4O15374 487 aa14.57□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 KCNE1P15382 129 aa14.57□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 RFX1P22670 979 aa14.57□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 TARSP26639 723 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 TRAPPC10P48553 1259 aa14.57□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 PDIA5Q14554 519 aa14.57□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 SLC10A6Q3KNW5 377 aa14.57□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 PDXDC1Q6P996 788 aa14.57□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 ANKS3Q6ZW76 656 aa14.57□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 MTSS1LQ765P7 747 aa14.57□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 KIAA2013Q8IYS2 634 aa14.57□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 HS6ST3Q8IZP7 471 aa14.57□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF461Q8TAF7 563 aa14.57□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 UROC1Q96N76 676 aa14.57□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 PNMA5Q96PV4 448 aa14.57□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 TMEM134Q9H6X4 195 aa14.57□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 LTB4R2Q9NPC1 389 aa14.57□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 CNTN3Q9P232 1028 aa14.57□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa14.57□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 FAM170BA6NMN3 283 aa14.56□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa14.56□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 FAM78AQ5JUQ0 283 aa14.56□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 KCNG4Q8TDN1 519 aa14.56□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 HEBP1Q9NRV9 189 aa14.56□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 FBXL5Q9UKA1 691 aa14.56□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 SPTBN2O15020 2390 aa14.56□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 MIA3Q5JRA6 1907 aa14.56□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa14.55□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 ECI2O75521 394 aa14.55□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 MCF2P10911 925 aa14.55□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 HARSP12081 509 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 ATF2P15336 505 aa14.55□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 ARPP19P56211 112 aa14.55□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 PRKCQQ04759 706 aa14.55□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 SPAG1Q07617 926 aa14.55□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 GRM2Q14416 872 aa14.55□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 UBXN2BQ14CS0 331 aa14.55□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 TSSK4Q6SA08 328 aa14.55□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 MPZL3Q6UWV2 235 aa14.55□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 TPRG1Q6ZUI0 275 aa14.55□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 TCEAL8Q8IYN2 117 aa14.55□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa14.55□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 NELL1Q92832 810 aa14.55□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 CLDN23Q96B33 292 aa14.55□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 RSPRY1Q96DX4 576 aa14.55□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 CORO1BQ9BR76 489 aa14.55□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 CRISPLD1Q9H336 500 aa14.55□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 KMT5AQ9NQR1 393 aa14.55□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 CEP72Q9P209 647 aa14.55□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 MAPTP10636 758 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 TDGF1P13385 188 aa14.54□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 GJA1P17302 382 aa14.54□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 GUCY2FP51841 1108 aa14.54□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 WDR44Q5JSH3 913 aa14.54□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa14.54□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 RTL10Q7L3V2 364 aa14.54□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 SHDQ96IW2 340 aa14.54□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 SUSD3Q96L08 255 aa14.54□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 ACAP3Q96P50 834 aa14.54□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 PLIN2Q99541 437 aa14.54□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 SEMA4AQ9H3S1 761 aa14.54□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 GDE1Q9NZC3 331 aa14.54□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 DNM3Q9UQ16 869 aa14.54□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 INSL5Q9Y5Q6 135 aa14.54□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 PPEF2O14830 753 aa14.53□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 SYN3O14994 580 aa14.53□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 TRAPPC3O43617 180 aa14.53□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 FAM189A1O60320 539 aa14.53□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 CXCL8P10145 99 aa14.53□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 PTPN2P17706 415 aa14.53□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 GUCY2CP25092 1073 aa14.53□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 TNFSF9P41273 254 aa14.53□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 YARSP54577 528 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms