RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 WEE2P0C1S8 567 aa22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF235Q14590 738 aa22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 IMPG1Q17R60 797 aa22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 P3H1Q32P28 736 aa22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 FAM49BQ9NUQ9 324 aa22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 TJP2Q9UDY2 1190 aa22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 MSH4O15457 936 aa22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 TADA2AO75478 443 aa22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 USP33Q8TEY7 942 aa22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 AGAP3Q96P47 875 aa22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 PPP1R37O75864 691 aa22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 SKIP12755 728 aa22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 ATL2Q8NHH9 583 aa22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 AGR3Q8TD06 166 aa22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC138Q96M89 665 aa22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 PSD3Q9NYI0 1048 aa22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 SLC26A4O43511 780 aa22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 UPP2O95045 317 aa22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 RPS6P62753 249 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 HIF1AQ16665 826 aa22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 EPC2Q52LR7 807 aa22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 FSCBQ5H9T9 825 aa22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 NUDCD3Q8IVD9 361 aa22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 MGEA5O60502 916 aa22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 PLA2G4AP47712 749 aa22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 RBBP7Q16576 425 aa22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 KAZALD1Q96I82 304 aa22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 RIT2Q99578 217 aa22.22■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 ZBTB22O15209 634 aa22.21■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 VEPH1Q14D04 833 aa22.21■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 GRAMD1BQ3KR37 738 aa22.21■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.21■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 EGFL8Q99944 293 aa22.21■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 SLC15A2Q16348 729 aa22.21■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 UBA3Q8TBC4 463 aa22.21■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 ACER1Q8TDN7 264 aa22.21■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 NDFIP2Q9NV92 336 aa22.21■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 H0Y3Z8 333 aa22.21■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.21■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 RUSC1Q9BVN2 902 aa22.21■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 TRIM15Q9C019 465 aa22.21■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa22.21■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 A0A1W2PQJ5 194 aa22.21■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 KRT80Q6KB66 452 aa22.21■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 ECT2Q9H8V3 914 aa22.21■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa22.21■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 TFR2Q9UP52 801 aa22.21■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 MEGF6O75095 1541 aa22.2■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 RPS6KA5O75582 802 aa22.2■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 SLC25A27O95847 323 aa22.2■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.2■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 CHST13Q8NET6 341 aa22.2■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 EPAS1Q99814 870 aa22.2■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 GOLGA8RI6L899 631 aa22.2■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 EXTL3O43909 919 aa22.2■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 ULK4Q96C45 1275 aa22.2■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 PHF2O75151 1096 aa22.2■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 TYK2P29597 1187 aa22.2■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 PPP4CP60510 307 aa22.2■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 PNKPQ96T60 521 aa22.2■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 L3MBTL1Q9Y468 752 aa22.2■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 UVRAGQ9P2Y5 699 aa22.2■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC78A2IDD5 438 aa22.2■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 ANP32DO95626 131 aa22.2■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 GYS1P13807 737 aa22.2■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 NAB2Q15742 525 aa22.2■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 GIPC2Q8TF65 315 aa22.2■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 TMEM8AQ9HCN3 771 aa22.2■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 KLC4Q9NSK0 619 aa22.2■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 CDC42EP1Q00587 391 aa22.19■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 KCNA1Q09470 495 aa22.19■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 TROAPQ12815 778 aa22.19■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 NFIAQ12857 509 aa22.19■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 IER5Q5VY09 327 aa22.19■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 MAGEB2O15479 319 aa22.19■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 NPTXRO95502 500 aa22.19■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 HSD17B4P51659 736 aa22.19■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 TRIM62Q9BVG3 475 aa22.19■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 HPSEQ9Y251 543 aa22.19■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 SLC13A4Q9UKG4 626 aa22.19■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 CELF2O95319 508 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
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