RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 FAM213AQ9BRX8 229 aa29.35■■■□□ 2.29
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TPGS1-201ENST00000359315 CDH22Q9UJ99 828 aa29.35■■■□□ 2.29
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TPGS1-201ENST00000359315 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP29.34■■■□□ 2.29
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TPGS1-201ENST00000359315 ZNF507Q8TCN5 953 aa29.34■■■□□ 2.29
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TPGS1-201ENST00000359315 PPEF2O14830 753 aa29.33■■■□□ 2.29
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TPGS1-201ENST00000359315 ARMCX5Q6P1M9 558 aa29.32■■■□□ 2.28
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TPGS1-201ENST00000359315 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
TPGS1-201ENST00000359315 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
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TPGS1-201ENST00000359315 S1PR5Q9H228 398 aa29.32■■■□□ 2.28
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TPGS1-201ENST00000359315 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa29.31■■■□□ 2.28
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TPGS1-201ENST00000359315 ASB7Q9H672 318 aa29.29■■■□□ 2.28
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TPGS1-201ENST00000359315 NUB1Q9Y5A7 615 aa29.29■■■□□ 2.28
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TPGS1-201ENST00000359315 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
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TPGS1-201ENST00000359315 SPATA31D3P0C874 917 aa29.27■■■□□ 2.28
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TPGS1-201ENST00000359315 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
TPGS1-201ENST00000359315 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa29.27■■■□□ 2.28
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TPGS1-201ENST00000359315 GPD1LQ8N335 351 aa29.27■■■□□ 2.28
TPGS1-201ENST00000359315 BEST2Q8NFU1 509 aa29.27■■■□□ 2.28
TPGS1-201ENST00000359315 SUSD6Q92537 303 aa29.27■■■□□ 2.28
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TPGS1-201ENST00000359315 SCARA3Q6AZY7 606 aa29.26■■■□□ 2.27
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