RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 DKK3Q9UBP4 350 aa5.17□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 CCDC189A1A4V9 331 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 IL18RAPO95256 599 aa5.17□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 ARFIP2P53365 341 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 TCP10Q12799 353 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 MFSD14CQ5VZR4 134 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 SPOPLQ6IQ16 392 aa5.16□□□□□ -1.58
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