RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 NOP2P46087 812 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 APLP1P51693 650 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 MYL6P60660 151 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 CDR2Q01850 454 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 CATSPER4Q7RTX7 472 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 PCDHB18PQ96TA0 734 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 CFHR5Q9BXR6 569 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 ISCUQ9H1K1 167 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 UMODL1Q5DID0 1318 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 SRGAP2O75044 1071 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 TRPA1O75762 1119 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 FMO1Q01740 532 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 CXCL17Q6UXB2 119 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 ASB7Q9H672 318 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 SNX12Q9UMY4 172 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 ANKRD62A6NC57 917 aa20.58■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 FTLP02792 175 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 ELNP15502 786 aa20.58■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 ABCB4P21439 1286 aa20.58■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 BPIFB4P59827 614 aa20.58■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 NKX3-2P78367 333 aa20.58■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 SLC10A6Q3KNW5 377 aa20.58■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 NME8Q8N427 588 aa20.58■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 UBXN4Q92575 508 aa20.58■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 ACAP3Q96P50 834 aa20.58■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa20.58■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 ANK1P16157 1881 aa20.58■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 GRID2IPA4D2P6 1211 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 RTN2O75298 545 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 NFICP08651 508 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 GZMAP12544 262 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 PRLRP16471 622 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 JADE1Q6IE81 842 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 THAP2Q9H0W7 228 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 ELF2Q15723 593 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 SLC27A1Q6PCB7 646 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 TMEM270Q6UE05 265 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 TLR10Q9BXR5 811 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 CNTN6Q9UQ52 1028 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 MROH7Q68CQ1 1323 aa20.56■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 FAM170AA1A519 330 aa20.56■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 NCK2O43639 380 aa20.56■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 ADAMTS4O75173 837 aa20.56■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 HOXD10P28358 340 aa20.56■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 GRM5P41594 1212 aa20.56■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 SNX17Q15036 470 aa20.56■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 ZNF699Q32M78 642 aa20.56■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 NBPF20Q3BBV1 942 aa20.56■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 NOTUMQ6P988 496 aa20.56■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 ZNF710Q8N1W2 664 aa20.56■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 TPCN2Q8NHX9 752 aa20.56■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 SLC35G2Q8TBE7 412 aa20.56■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 TMEM40Q8WWA1 233 aa20.56■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 RFFLQ8WZ73 363 aa20.56■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 XYLT2Q9H1B5 865 aa20.56■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 SRRDQ9UH36 339 aa20.56■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 TSKSQ9UJT2 592 aa20.56■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 NCANO14594 1321 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 NPTXRO95502 500 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 FTCDO95954 541 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 CALCAP01258 141 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 KRT19P08727 400 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 TAF2Q6P1X5 1199 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 ZNF677Q86XU0 584 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 C1orf127Q8N9H9 656 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 CD99L2Q8TCZ2 262 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 ANKRD7Q92527 254 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 NIF3L1Q9GZT8 377 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 HYOU1Q9Y4L1 999 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 ZNF185O15231 689 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 TCP1P17987 556 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 AXLP30530 894 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 MEI1Q5TIA1 1274 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 LRRC57Q8N9N7 239 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 GOLGA1Q92805 767 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 ARHGEF26Q96DR7 871 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 OSBPL9Q96SU4 736 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 OSGEPQ9NPF4 335 aa20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms