RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329966.10

USP45-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 45, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP45, Length 1,444 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP45-202ENST00000329966 CLDND1Q9NY35 253 aa22.89■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 IRAK3Q9Y616 596 aa22.89■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 ADAM15Q13444 863 aa22.88■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 FAM171A1Q5VUB5 890 aa22.88■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 SPATA1Q5VX52 437 aa22.88■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.88■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 ASB7Q9H672 318 aa22.88■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 PDE11AQ9HCR9 933 aa22.88■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 H3BQ06 376 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 TBX10O75333 385 aa22.87■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 LDHAP00338 332 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 CNPP09543 421 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 CYP3A5P20815 502 aa22.87■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 KCNA5P22460 613 aa22.87■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 RPL9P32969 192 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 GLUD2P49448 558 aa22.87■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 DSG1Q02413 1049 aa22.87■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 KCNC3Q14003 757 aa22.87■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 TMEM132DQ14C87 1099 aa22.87■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 CD302Q8IX05 232 aa22.87■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 EFHBQ8N7U6 833 aa22.87■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 RDH13Q8NBN7 331 aa22.87■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.87■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 FBXL18Q96ME1 805 aa22.87■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 THEGQ9P2T0 379 aa22.87■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 URODP06132 367 aa22.86■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 LRPAP1P30533 357 aa22.86■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 USP41Q3LFD5 358 aa22.86■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 ISM2Q6H9L7 571 aa22.86■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 LLGL2Q6P1M3 1020 aa22.86■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.86■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 SMARCE1Q969G3 411 aa22.86■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 KLHL5Q96PQ7 755 aa22.86■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.86■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 CLEC1BQ9P126 229 aa22.86■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 PTPRJQ12913 1337 aa22.86■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 IL18RAPO95256 599 aa22.85■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 RPL17P18621 184 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 CEP57Q86XR8 500 aa22.85■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.85■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.85■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 GSDMAQ96QA5 445 aa22.85■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 DMAC2Q9NW81 257 aa22.85■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 STK39Q9UEW8 545 aa22.85■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 COG5Q9UP83 839 aa22.85■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 DERAQ9Y315 318 aa22.85■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 C2CD2Q9Y426 696 aa22.85■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 ZNF233A6NK53 670 aa22.84■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 SMC2O95347 1197 aa22.84■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 FGFR3P22607 806 aa22.84■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 TKTP29401 623 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 KCNQ1P51787 676 aa22.84■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 CLUL1Q15846 466 aa22.84■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 KIAA1841Q6NSI8 718 aa22.84■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.84■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 BEST2Q8NFU1 509 aa22.84■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 TSPAN18Q96SJ8 248 aa22.84■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 TTPALQ9BTX7 342 aa22.84■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 RXFP1Q9HBX9 757 aa22.84■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 MAN1B1Q9UKM7 699 aa22.84■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa22.84■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 VWA8A3KMH1 1905 aa22.84■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 PDXKO00764 312 aa22.83■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 SPTLC1O15269 473 aa22.83■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 TEX28O15482 410 aa22.83■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 BMP6P22004 513 aa22.83■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 CAMK4Q16566 473 aa22.83■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 C9orf57Q5W0N0 161 aa22.83■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 DPP3Q9NY33 737 aa22.83■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 TTC28Q96AY4 2481 aa22.83■■□□□ 1.25
USP45-202ENST00000329966 ANO9A1A5B4 782 aa22.82■■□□□ 1.24
USP45-202ENST00000329966 ADAM12O43184 909 aa22.82■■□□□ 1.24
USP45-202ENST00000329966 EPCAMP16422 314 aa22.82■■□□□ 1.24
USP45-202ENST00000329966 PRCPP42785 496 aa22.82■■□□□ 1.24
USP45-202ENST00000329966 CASP4P49662 377 aa22.82■■□□□ 1.24
USP45-202ENST00000329966 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
USP45-202ENST00000329966 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms