RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329397.5

PTP4A3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase type IVA, member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTP4A3, Length 2,785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A3-201ENST00000329397 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa18.51■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 KRT27Q7Z3Y8 459 aa18.51■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 GLIS1Q8NBF1 620 aa18.51■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 MCM8Q9UJA3 840 aa18.51■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 ANAPC5Q9UJX4 755 aa18.51■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 FEM1BQ9UK73 627 aa18.51■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 STK38LQ9Y2H1 464 aa18.51■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 GPC3P51654 580 aa18.5■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 BICD1Q96G01 975 aa18.5■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 DCLK3Q9C098 648 aa18.5■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 ECT2Q9H8V3 914 aa18.5■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 WHRNQ9P202 907 aa18.5■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa18.5■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 DOCK5Q9H7D0 1870 aa18.5■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 CCDC189A1A4V9 331 aa18.5■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 TCF4P15884 667 aa18.5■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 NCALDP61601 193 aa18.5■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 ALCAMQ13740 583 aa18.5■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 KAZNQ674X7 775 aa18.5■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 MCOLN2Q8IZK6 566 aa18.5■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 FAM151AQ8WW52 585 aa18.5■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 ZNF516Q92618 1163 aa18.5■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 CCDC134Q9H6E4 229 aa18.5■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 SPAG7O75391 227 aa18.49■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa18.49■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 PTGER2P43116 358 aa18.49■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 CYP24A1Q07973 514 aa18.49■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 NEDD9Q14511 834 aa18.49■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa18.49■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 FAM160B2Q86V87 743 aa18.49■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 MORC4Q8TE76 937 aa18.49■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 SPOCK2Q92563 424 aa18.49■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 P3H4Q92791 437 aa18.49■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 SUFUQ9UMX1 484 aa18.49■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa18.49■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 PIAS1O75925 651 aa18.49■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 MAPTP10636 758 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 KRT10P13645 584 aa18.49■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 PSMC4P43686 418 aa18.49■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 CGB2Q6NT52 195 aa18.49■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 MAP4K3Q8IVH8 894 aa18.49■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 FITM2Q8N6M3 262 aa18.49■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 KIFAP3Q92845 792 aa18.49■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 WNK4Q96J92 1243 aa18.49■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 KIF9Q9HAQ2 790 aa18.49■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 PTPRJQ12913 1337 aa18.49■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 MYPNQ86TC9 1320 aa18.49■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 UNGP13051 313 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 DSG3P32926 999 aa18.48■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 ACOT2P49753 483 aa18.48■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 MTM1Q13496 603 aa18.48■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 PGM5Q15124 567 aa18.48■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 TMED2Q15363 201 aa18.48■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 WLSQ5T9L3 541 aa18.48■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 HAUS1Q96CS2 278 aa18.48■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 CEP170P1Q96L14 293 aa18.48■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 RMDN3Q96TC7 470 aa18.48■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa18.48■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 ZNF862O60290 1169 aa18.48■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 OAS1P00973 400 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 ETS1P14921 441 aa18.48■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 STX2P32856 288 aa18.48■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 FAM182AQ5T1J6 154 aa18.48■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 COQ4Q9Y3A0 265 aa18.48■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 GAS8O95995 478 aa18.47■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 ITIH2P19823 946 aa18.47■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 PSMC5P62195 406 aa18.47■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 MGAT5Q09328 741 aa18.47■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 PTK6Q13882 451 aa18.47■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 SEZ6Q53EL9 994 aa18.47■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 TMEM63BQ5T3F8 832 aa18.47■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 PCNX4Q63HM2 1172 aa18.47■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 SERPINB12Q96P63 405 aa18.47■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 GABBR1Q9UBS5 961 aa18.47■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 KRT16P08779 473 aa18.47■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 TNNI1P19237 187 aa18.47■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 MYO1EQ12965 1108 aa18.47■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 IZUMO3Q5VZ72 239 aa18.47■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 GSTA5Q7RTV2 222 aa18.47■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 VTI1AQ96AJ9 217 aa18.47■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 AKT1S1Q96B36 256 aa18.47■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 C1orf112Q9NSG2 853 aa18.47■□□□□ 0.55
PTP4A3-201ENST00000329397 FDX1P10109 184 aa18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms