RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297623.6

C9orf24-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 24, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf24, Length 1,151 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf24-201ENST00000297623 UBE3AQ05086 875 aa16.16■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 SPAG1Q07617 926 aa16.16■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 CCDC40Q4G0X9 1142 aa16.16■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa16.16■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 EFCAB13Q8IY85 973 aa16.16■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 SLC39A11Q8N1S5 342 aa16.16■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 C17orf80Q9BSJ5 609 aa16.16■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 CXCL16Q9H2A7 254 aa16.16■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 DPP3Q9NY33 737 aa16.16■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 HCSTQ9UBK5 93 aa16.16■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 ITGA11Q9UKX5 1188 aa16.16■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 PODXLO00592 558 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 TRAPPC3O43617 180 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 ARHGEF15O94989 841 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 MARSP56192 900 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 PLCB3Q01970 1234 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 UPP1Q16831 310 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 ARNTL2Q8WYA1 636 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 EEF2KMTQ96G04 330 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 IGSF21Q96ID5 467 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 DNAJC25Q9H1X3 360 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 THAP9Q9H5L6 903 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 MTUS1Q9ULD2 1270 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 LZTS1Q9Y250 596 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.18
C9orf24-201ENST00000297623 ARHGEF37A1IGU5 675 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 H3BNC9 293 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 B4GALT3O60512 393 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 TADA2AO75478 443 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 FGF18O76093 207 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 B3GAT3O94766 335 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 GTF2H1P32780 548 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 PNPLA4P41247 253 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 CLCNKBP51801 687 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 MYL5Q02045 173 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 ANO6Q4KMQ2 910 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 KLHL23Q8NBE8 558 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 BORCS6Q96GS4 357 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 LRCH3Q96II8 777 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 ZNF560Q96MR9 790 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 BPIFA3Q9BQP9 254 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 FUCA2Q9BTY2 467 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 MTMR12Q9C0I1 747 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 LMAN2LQ9H0V9 348 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 ADAM28Q9UKQ2 775 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 NUB1Q9Y5A7 615 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP16.14■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 ANO9A1A5B4 782 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 PBX3P40426 434 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 WNT7BP56706 349 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 RBP5P82980 135 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 GPM6BQ13491 265 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 TCERG1LQ5VWI1 586 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 C9orf57Q5W0N0 161 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 LRRC52Q8N7C0 313 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 ANP32EQ9BTT0 268 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 SMTNL1A8MU46 457 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 PIRO00625 290 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 PHACTR2O75167 634 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 KIF4AO95239 1232 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 ITGB3P05106 788 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 ITGB1P05556 798 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 ZNF165P49910 485 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 MYO1EQ12965 1108 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 BIRC3Q13489 604 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 TRPC3Q13507 836 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 PTPROQ16827 1216 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 SV2CQ496J9 727 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 C1orf127Q8N9H9 656 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 OR5B17Q8NGF7 314 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 MED15Q96RN5 788 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 PAAF1Q9BRP4 392 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 CERS4Q9HA82 394 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 MARCH5Q9NX47 278 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 BECN2A8MW95 431 aa16.11■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
C9orf24-201ENST00000297623 KRT19P08727 400 aa16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.7 ms