RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa25.74■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa25.74■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EHBP1Q8NDI1 1231 aa25.74■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MYRIPQ8NFW9 859 aa25.74■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BAP1Q92560 729 aa25.74■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLAGL2Q9UPG8 496 aa25.74■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FHOD1Q9Y613 1164 aa25.74■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa25.74■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CST3P01034 146 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ITGB8P26012 769 aa25.74■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KYAT1Q16773 422 aa25.74■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa25.74■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DBF4BQ8NFT6 615 aa25.74■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KIF18AQ8NI77 898 aa25.74■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF592Q92610 1267 aa25.74■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 COQ4Q9Y3A0 265 aa25.74■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HLA-DRAP01903 254 aa25.73■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ETF1P62495 437 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa25.73■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ALKAL1Q6UXT8 129 aa25.73■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARHGEF19Q8IW93 802 aa25.73■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FBXL13Q8NEE6 735 aa25.73■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZFP42Q96MM3 310 aa25.73■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RAB20Q9NX57 234 aa25.73■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRIM43BA6NCK2 446 aa25.72■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PMM2O15305 246 aa25.72■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 P4HA2O15460 535 aa25.72■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NDUFA10O95299 355 aa25.72■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SURF1Q15526 300 aa25.72■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPOPLQ6IQ16 392 aa25.72■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RRAGAQ7L523 313 aa25.72■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa25.72■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DEFB128Q7Z7B8 93 aa25.72■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC170Q8IYT3 715 aa25.72■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RNF169Q8NCN4 708 aa25.72■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KIF12Q96FN5 646 aa25.72■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLCB1Q9NQ66 1216 aa25.72■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM191BP0C7N4 346 aa25.72■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 UCHL3P15374 230 aa25.72■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PIK3CAP42336 1068 aa25.72■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 YARSP54577 528 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DUOXA2Q1HG44 320 aa25.72■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa25.72■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PDXDC1Q6P996 788 aa25.72■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ASB7Q9H672 318 aa25.72■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM132DQ14C87 1099 aa25.71■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IQCEQ6IPM2 695 aa25.71■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AGMOQ6ZNB7 445 aa25.71■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C1orf127Q8N9H9 656 aa25.71■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KAT5Q92993 513 aa25.71■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TATDN2Q93075 761 aa25.71■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ALPK3Q96L96 1907 aa25.7■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PHACTR2O75167 634 aa25.7■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP25.7■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CETN1Q12798 172 aa25.7■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SYT10Q6XYQ8 523 aa25.7■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ACRBPQ8NEB7 543 aa25.7■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 VWCEQ96DN2 955 aa25.7■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CNTN3Q9P232 1028 aa25.7■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa25.7■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SIX4Q9UIU6 781 aa25.7■■□□□ 1.71
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 A0A0U1RQF3 1178 aa25.7■■□□□ 1.7
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LRRC53A6NM62 1247 aa25.7■■□□□ 1.7
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ITGA4P13612 1032 aa25.7■■□□□ 1.7
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MLH1P40692 756 aa25.7■■□□□ 1.7
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa25.7■■□□□ 1.7
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa25.7■■□□□ 1.7
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RGS18Q9NS28 235 aa25.7■■□□□ 1.7
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NCOA4Q13772 614 aa25.69■■□□□ 1.7
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CXorf38Q8TB03 319 aa25.69■■□□□ 1.7
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GAD1Q99259 594 aa25.69■■□□□ 1.7
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRAIPQ9BWF2 469 aa25.69■■□□□ 1.7
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 APEX2Q9UBZ4 518 aa25.69■■□□□ 1.7
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa25.68■■□□□ 1.7
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PTGESO14684 152 aa25.68■■□□□ 1.7
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TNNC2P02585 160 aa25.68■■□□□ 1.7
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ITGB3P05106 788 aa25.68■■□□□ 1.7
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MYL6P60660 151 aa25.68■■□□□ 1.7
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RAPGEF1Q13905 1077 aa25.68■■□□□ 1.7
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ECHDC2Q86YB7 292 aa25.68■■□□□ 1.7
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MIOSQ9NXC5 875 aa25.68■■□□□ 1.7
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DNAJC12Q9UKB3 198 aa25.68■■□□□ 1.7
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C9IYK1 514 aa25.67■■□□□ 1.7
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KRT19P08727 400 aa25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms