RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA8RI6L899 631 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF677Q86XU0 584 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 DDIASQ8IXT1 998 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 ALG6Q9Y672 507 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 COMTP21964 271 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 CARSP49589 748 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 ACOT2P49753 483 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 KDSRQ06136 332 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF235Q14590 738 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 COG2Q14746 738 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 ARL8AQ96BM9 186 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL11Q9NVR0 708 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 AGAP1Q9UPQ3 857 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 LCP1P13796 627 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 IRAK1P51617 712 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 CENPCQ03188 943 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 SPON2Q9BUD6 331 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC90BQ9GZT6 254 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM8AQ9HCN3 771 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 BATF3Q9NR55 127 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 LBRQ14739 615 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 TKFCQ3LXA3 575 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 KRT35Q92764 455 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 MYO1DO94832 1006 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 KLRC1P26715 233 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 TTC23LQ6PF05 361 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 TEKT2Q9UIF3 430 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 NNMTP40261 264 aa22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 ASIC4Q96FT7 647 aa22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 PBXIP1Q96AQ6 731 aa22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 ENO1P06733 434 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 KCNA2P16389 499 aa22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 CARD9Q9H257 536 aa22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 PAK5Q9P286 719 aa22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 ADGRB3O60242 1522 aa22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 KRT4P19013 534 aa22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 KCNA1Q09470 495 aa22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 KCNK16Q96T55 309 aa22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 L2HGDHQ9H9P8 463 aa22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 MCEEQ96PE7 176 aa22.21■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 NPHS2Q9NP85 383 aa22.21■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 FAM107AO95990 144 aa22.21■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 C4orf33Q8N1A6 199 aa22.21■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 MED15Q96RN5 788 aa22.21■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 KIF17Q9P2E2 1029 aa22.21■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 MAGEA4P43358 317 aa22.21■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 RAD51Q06609 339 aa22.21■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.21■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 OR2W6PQ8NHA6 318 aa22.21■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 RALAP11233 206 aa22.21■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 HMGCS2P54868 508 aa22.21■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 INPP5AQ14642 412 aa22.21■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.21■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 SENP2Q9HC62 589 aa22.21■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 GGT7Q9UJ14 662 aa22.21■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM120BA0PK00 339 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 DFFAO00273 331 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 RFC5P40937 340 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 SEPT1Q8WYJ6 367 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 CYFIP2Q96F07 1278 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 RMDN2Q96LZ7 410 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 RSAD1Q9HA92 442 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 AIPL1Q9NZN9 384 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 SCFD1Q8WVM8 642 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM143Q96AN5 459 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms