RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 SLC30A5Q8TAD4 765 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 AGPAT1Q99943 283 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 AAASQ9NRG9 546 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 TAS2R1Q9NYW7 299 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 LMTK3Q96Q04 1460 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 C5P01031 1676 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 LMO7Q8WWI1 1683 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 FAM13AO94988 1023 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 ACAP1Q15027 740 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 KCTD21Q4G0X4 260 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 SLC45A4Q5BKX6 768 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 LPCAT4Q643R3 524 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 CFAP57Q96MR6 1250 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 CYP4F11Q9HBI6 524 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 MYO3BQ8WXR4 1341 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 CYP11B2P19099 503 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 MYL7Q01449 175 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 ASPHQ12797 758 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 LSAMPQ13449 338 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 TRIP10Q15642 601 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 TRIM67Q6ZTA4 783 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 ZBED8Q8IZ13 594 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 SLC35C1Q96A29 364 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 TRAIPQ9BWF2 469 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 TSSK1BQ9BXA7 367 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 KCTD10Q9H3F6 313 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 TMOD2Q9NZR1 351 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 DNM3Q9UQ16 869 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 MYH3P11055 1940 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 MEI4A8MW99 385 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 ASMTLO95671 621 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 PCP11498 1178 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 NOP14P78316 857 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 C2CD6Q53TS8 623 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 IFT43Q96FT9 208 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 STK33Q9BYT3 514 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF148Q9UQR1 794 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 M0R2N6 131 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 RRM1P23921 792 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 RFC4P35249 363 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 MOGSQ13724 837 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 PDK4Q16654 411 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 PPM1KQ8N3J5 372 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 DAGLBQ8NCG7 672 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 PPP2R3CQ969Q6 453 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 ELMO3Q96BJ8 720 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 KIAA1586Q9HCI6 787 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 KLHL11Q9NVR0 708 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 UMODL1Q5DID0 1318 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 USP17L5A8MUK1 530 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 ASLP04424 464 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 MYL2P10916 166 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 CDC16Q13042 620 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 NR1H3Q13133 447 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 MAPK6Q16659 721 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 GSTA3Q16772 222 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 EDRF1Q3B7T1 1238 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 RABGAP1LQ5R372 815 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 SCUBE1Q8IWY4 988 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 GSDMBQ8TAX9 411 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 PIGBQ92521 554 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 REEP2Q9BRK0 252 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 GRIP2Q9C0E4 1043 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 BHMT2Q9H2M3 363 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 PCIF1Q9H4Z3 704 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 WHRNQ9P202 907 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 IKBKGQ9Y6K9 419 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 CHD4Q14839 1912 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 FCHO1O14526 889 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 CHMP2AO43633 222 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 BCRP11274 1271 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 CTNNA2P26232 953 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 GRK7Q8WTQ7 553 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 WNT8AQ9H1J5 351 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 ANAPC7Q9UJX3 599 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.6 ms