RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258424.2

COX5B-201, Transcript of cytochrome c oxidase subunit 5B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX5B, Length 712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5B-201ENST00000258424 UROC1Q96N76 676 aa22.85■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa22.85■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 GPR62Q9BZJ7 368 aa22.85■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 CD320Q9NPF0 282 aa22.85■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 HIDE1A8MVS5 230 aa22.84■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 PODXLO00592 558 aa22.84■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 SOD2P04179 222 aa22.84■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 CTSAP10619 480 aa22.84■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 CYP2J2P51589 502 aa22.84■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 HYAL1Q12794 435 aa22.84■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.84■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 EFCAB13Q8IY85 973 aa22.84■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 FBXL18Q96ME1 805 aa22.84■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 ASB7Q9H672 318 aa22.84■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 RMND1Q9NWS8 449 aa22.84■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 FAM50BQ9Y247 325 aa22.84■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 BDP1A6H8Y1 2624 aa22.84■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa22.83■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 TADA2AO75478 443 aa22.83■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 TMEM132DQ14C87 1099 aa22.83■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 FAM84AQ96KN4 292 aa22.83■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 B3GALT6Q96L58 329 aa22.83■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa22.83■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 MAN1B1Q9UKM7 699 aa22.83■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 NCOR1O75376 2440 aa22.83■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 SCN1AP35498 2009 aa22.82■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 C2orf71A6NGG8 1288 aa22.82■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 PDXKO00764 312 aa22.82■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 B3GAT3O94766 335 aa22.82■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 IL18RAPO95256 599 aa22.82■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 PTPN14Q15678 1187 aa22.82■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 CAMK4Q16566 473 aa22.82■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 SPATA1Q5VX52 437 aa22.82■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 ISM2Q6H9L7 571 aa22.82■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa22.82■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.82■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 GOLGA5Q8TBA6 731 aa22.82■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 TSPAN18Q96SJ8 248 aa22.82■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 PDE11AQ9HCR9 933 aa22.82■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 DERAQ9Y315 318 aa22.82■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.243e-6■■■■■ 137.9
COX5B-201ENST00000258424 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.81■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 PPEF2O14830 753 aa22.81■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 PER2O15055 1255 aa22.81■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 KIF20AO95235 890 aa22.81■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 CXCL14O95715 111 aa22.81■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 CYP3A5P20815 502 aa22.81■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 LRPAP1P30533 357 aa22.81■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 CA8P35219 290 aa22.81■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 LTBRP36941 435 aa22.81■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 PRCPP42785 496 aa22.81■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 BRCC3P46736 316 aa22.81■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 NRIP1P48552 1158 aa22.81■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 CTC1Q2NKJ3 1217 aa22.81■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 RDH13Q8NBN7 331 aa22.81■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 IGFLR1Q9H665 355 aa22.81■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 C2CD2Q9Y426 696 aa22.81■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 ZNF233A6NK53 670 aa22.8■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 I3L4J1 428 aa22.8■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 LINC01565O15544 149 aa22.8■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 NR3C1P04150 777 aa22.8■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 RPL9P32969 192 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 GLUD2P49448 558 aa22.8■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.8■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 TMEM31Q5JXX7 168 aa22.8■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 BEST2Q8NFU1 509 aa22.8■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.8■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 LRFN3Q9BTN0 628 aa22.8■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 TLE6Q9H808 572 aa22.8■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22.8■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 CHST7Q9NS84 486 aa22.8■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 DMAC2Q9NW81 257 aa22.8■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 STK39Q9UEW8 545 aa22.8■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.8■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 IRAK3Q9Y616 596 aa22.8■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 PTPRJQ12913 1337 aa22.8■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 PLXNA3P51805 1871 aa22.79■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 BIN1O00499 593 aa22.79■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 C2CD2LO14523 706 aa22.79■■□□□ 1.24
COX5B-201ENST00000258424 XPOTO43592 962 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
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