RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237247.10

SGIP1-201, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SGIP1, Length 3,997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-201ENST00000237247 NFIXQ14938 502 aa6.7□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 SLC44A4Q53GD3 710 aa6.7□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 RNF43Q68DV7 783 aa6.7□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 ASRGL1Q7L266 308 aa6.7□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 TXNRD3Q86VQ6 643 aa6.7□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 TTC30AQ86WT1 665 aa6.7□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa6.7□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6.7□□□□□ -1.34
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SGIP1-201ENST00000237247 CCDC17Q96LX7 622 aa6.69□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 TRIM51Q9BSJ1 452 aa6.69□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 NDUFA13Q9P0J0 144 aa6.69□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.69□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa6.69□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 KAT6BQ8WYB5 2073 aa6.69□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 PASKQ96RG2 1323 aa6.69□□□□□ -1.34
SGIP1-201ENST00000237247 PIK3CDO00329 1044 aa6.68□□□□□ -1.34
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