RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 C12orf56Q8IXR9 622 aa24.21■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 EFCAB13Q8IY85 973 aa24.21■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 GPD1LQ8N335 351 aa24.21■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 EFHBQ8N7U6 833 aa24.21■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 COG5Q9UP83 839 aa24.21■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 DERAQ9Y315 318 aa24.2■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 VCANP13611 3396 aa24.19■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 NCK2O43639 380 aa24.19■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 BRCC3P46736 316 aa24.19■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 USP41Q3LFD5 358 aa24.19■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 RTP2Q5QGT7 225 aa24.19■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 CBWD2Q8IUF1 395 aa24.19■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 TMEM174Q8WUU8 243 aa24.19■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 PPP2R3CQ969Q6 453 aa24.19■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 KLHL5Q96PQ7 755 aa24.19■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 RXFP1Q9HBX9 757 aa24.19■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 DMAC2Q9NW81 257 aa24.19■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 CLDND1Q9NY35 253 aa24.19■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 CLEC1BQ9P126 229 aa24.19■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 THEGQ9P2T0 379 aa24.19■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 C2CD2Q9Y426 696 aa24.19■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP24.19■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 PPEF2O14830 753 aa24.18■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 TBX10O75333 385 aa24.18■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 CNPP09543 421 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 GLUD2P49448 558 aa24.18■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 SCARA3Q6AZY7 606 aa24.18■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa24.18■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 GPR65Q8IYL9 337 aa24.18■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 CCDC34Q96HJ3 373 aa24.18■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 GSDMAQ96QA5 445 aa24.18■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa24.18■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 I3L4J1 428 aa24.17■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 C2CD2LO14523 706 aa24.17■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 IL18RAPO95256 599 aa24.17■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 FGFR3P22607 806 aa24.17■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 TMEM132DQ14C87 1099 aa24.17■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 FAM171A1Q5VUB5 890 aa24.17■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 SLC22A17Q8WUG5 538 aa24.17■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 FAM84AQ96KN4 292 aa24.17■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 PDE11AQ9HCR9 933 aa24.17■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 LMBRD1Q9NUN5 540 aa24.17■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 ANO9A1A5B4 782 aa24.16■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 PIRO00625 290 aa24.16■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 PDXKO00764 312 aa24.16■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 KINO60870 393 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 KCNA5P22460 613 aa24.16■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 HS2ST1Q7LGA3 356 aa24.16■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 XXYLT1Q8NBI6 393 aa24.16■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 CXorf38Q8TB03 319 aa24.16■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 MSLNLQ96KJ4 702 aa24.16■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 TTPALQ9BTX7 342 aa24.16■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa24.16■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa24.16■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 SCN1AP35498 2009 aa24.16■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 ZNF233A6NK53 670 aa24.15■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 H3BQ06 376 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 TEX28O15482 410 aa24.15■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 URODP06132 367 aa24.15■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP24.15■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 CYP2J2P51589 502 aa24.15■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 LEXMQ3ZCV2 418 aa24.15■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 SLC9A9Q8IVB4 645 aa24.15■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 RDH13Q8NBN7 331 aa24.15■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 BEST2Q8NFU1 509 aa24.15■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 KIAA1586Q9HCI6 787 aa24.15■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 PTPRJQ12913 1337 aa24.15■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 XPOTO43592 962 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 TKTP29401 623 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 CA8P35219 290 aa24.14■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 COBLL1Q53SF7 1204 aa24.14■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 C9orf57Q5W0N0 161 aa24.14■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 NT5DC4Q86YG4 428 aa24.14■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA5Q8TBA6 731 aa24.14■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 116.7 ms