RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tomm70Q9CZW5 611 aa24.58■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm13276A0A087WR18 182 aa24.57■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ZxdbA2CE44 873 aa24.57■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc26a1P58735 704 aa24.57■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pank4Q80YV4 820 aa24.57■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Unc45bQ8CGY6 931 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rpl17Q9CPR4 184 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sdr42e1Q9D665 394 aa24.57■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CoasyQ9DBL7 563 aa24.57■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tpcn1Q9EQJ0 817 aa24.57■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Usp29Q9ES63 869 aa24.57■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atp6v0a1Q9Z1G4 839 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Large1Q9Z1M7 756 aa24.57■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 4930402K13RikB1AW18 415 aa24.56■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfp457L7N1X4 647 aa24.56■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hk1P17710 974 aa24.56■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ppp3ccP48455 513 aa24.56■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Smad4P97471 551 aa24.56■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ndst1Q3UHN9 882 aa24.56■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Grm6Q5NCH9 871 aa24.56■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc125Q5U465 500 aa24.56■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rnf168Q80XJ2 565 aa24.56■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc38Q8CDN8 563 aa24.56■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pcdha2Q91Y17 948 aa24.56■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tor1aip1Q921T2 595 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pin4Q9CWW6 131 aa24.56■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MymkQ9D1N4 221 aa24.56■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Galnt15Q9D2N8 638 aa24.56■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vnn1Q9Z0K8 512 aa24.56■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cd97Q9Z0M6 818 aa24.56■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ddx23D3Z0M9 819 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AfmO89020 608 aa24.55■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AdprhP54923 362 aa24.55■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hoxd13P70217 339 aa24.55■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pstpip1P97814 415 aa24.55■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 EfsQ64355 560 aa24.55■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 RetsatQ64FW2 609 aa24.55■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Krba1Q6NXZ1 1043 aa24.55■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr389Q7TRX7 312 aa24.55■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam129bQ8R1F1 749 aa24.55■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Q922C1 641 aa24.55■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Efhd1Q9D4J1 240 aa24.55■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 A0A1L1SQF0 893 aa24.54■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ttll10A4Q9F3 704 aa24.54■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 BhmtO35490 407 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gas2P11862 314 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ssr4Q62186 172 aa24.54■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Smad2Q62432 467 aa24.54■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dhx37Q6NZL1 1150 aa24.54■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Luc7l2Q7TNC4 392 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Abraxas1Q8BPZ8 407 aa24.54■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CarfQ8VHI4 689 aa24.54■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tubgcp2Q921G8 905 aa24.54■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Syde1Q9DBZ9 737 aa24.54■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 GabrqQ9JLF1 638 aa24.54■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prpf40aQ9R1C7 953 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Col6a3E9PWQ3 3284 aa24.53■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr663A0A1B0GSI9 319 aa24.53■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc4a11A2AJN7 862 aa24.53■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tnnc2P20801 160 aa24.53■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc7a1Q09143 622 aa24.53■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zscan4fQ3URS2 506 aa24.53■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Abi3bpQ59IW6 1179 aa24.53■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gpr61Q8C010 449 aa24.53■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn1r213Q8R278 384 aa24.53■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Psmd6Q99JI4 389 aa24.53■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kif17Q99PW8 1038 aa24.53■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rhobtb3Q9CTN4 611 aa24.53■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tlr5Q9JLF7 859 aa24.53■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm13212B1ASQ7 799 aa24.52■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm4307E9PZY4 289 aa24.52■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm4312K9J7E2 289 aa24.52■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Scrg1O88745 98 aa24.52■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tnnt2P50752 301 aa24.52■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mfsd14aP70187 490 aa24.52■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fut7Q11131 389 aa24.52■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Skap1Q3UUV5 355 aa24.52■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mysm1Q69Z66 819 aa24.52■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kdm1aQ6ZQ88 853 aa24.52■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tas2r125Q7M710 311 aa24.52■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hook1Q8BIL5 728 aa24.52■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trim61Q8JZK6 461 aa24.52■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Chst12Q99LL3 419 aa24.52■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mss51Q9D5Z5 446 aa24.52■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fzd2Q9JIP6 570 aa24.52■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wdr54Q9R0D8 334 aa24.52■■□□□ 1.52
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prr22F6TNE3 422 aa24.51■■□□□ 1.51
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AlbP07724 608 aa24.51■■□□□ 1.51
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 TxkP42682 527 aa24.51■■□□□ 1.51
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rpl13P47963 211 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc12a1P55014 1095 aa24.51■■□□□ 1.51
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 YwhahP68510 246 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmc5Q32NZ6 967 aa24.51■■□□□ 1.51
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pgap2Q3TQR0 254 aa24.51■■□□□ 1.51
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 LpoQ5SW46 710 aa24.51■■□□□ 1.51
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cd6Q61003 665 aa24.51■■□□□ 1.51
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cfap97Q6ZPR1 541 aa24.51■■□□□ 1.51
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sh3d21Q7TSG5 549 aa24.51■■□□□ 1.51
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Agap1Q8BXK8 857 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Leg1Q8C6C9 337 aa24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.8 ms