RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008088.8

Ttc9b-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttc9b, Length 2,052 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc7a14Q8BXR1 771 aa21.09■□□□□ 0.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fermt3Q8K1B8 665 aa21.09■□□□□ 0.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gdap1l1Q8VE33 370 aa21.09■□□□□ 0.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mettl13Q91YR5 698 aa21.09■□□□□ 0.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 PlekQ9JHK5 350 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cul1Q9WTX6 776 aa21.09■□□□□ 0.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Samd15F6XZJ7 620 aa21.09■□□□□ 0.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pou6f1Q07916 301 aa21.09■□□□□ 0.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ndufaf2Q59J78 168 aa21.09■□□□□ 0.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ahcyl2Q68FL4 613 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 GlmnQ8BZM1 596 aa21.09■□□□□ 0.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sh2b1Q91ZM2 756 aa21.09■□□□□ 0.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Katnbl1Q9CWJ3 299 aa21.09■□□□□ 0.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trpc3Q9QZC1 836 aa21.09■□□□□ 0.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc26a3Q9WVC8 757 aa21.09■□□□□ 0.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Wfdc16A2A5H4 111 aa21.08■□□□□ 0.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Znf804aA2AKY4 1200 aa21.08■□□□□ 0.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Prdm15E9Q8T2 1174 aa21.08■□□□□ 0.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kng1O08677 661 aa21.08■□□□□ 0.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfpm1O35615 995 aa21.08■□□□□ 0.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mybl1P51960 751 aa21.08■□□□□ 0.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fam193bQ3U2K0 892 aa21.08■□□□□ 0.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Spout1Q3UHX9 385 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zbtb17Q60821 794 aa21.08■□□□□ 0.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Jade3Q6IE82 823 aa21.08■□□□□ 0.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Stxbp5Q8K400 1152 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Six6os1Q9CTN5 574 aa21.08■□□□□ 0.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dydc1Q9D9T0 175 aa21.08■□□□□ 0.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Igdcc4Q9EQS9 1252 aa21.08■□□□□ 0.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cables1Q9ESJ1 568 aa21.08■□□□□ 0.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 EcsitQ9QZH6 435 aa21.08■□□□□ 0.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dpy19l4A2AJQ3 722 aa21.08■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 TroapB7ZNG4 668 aa21.08■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Spryd7Q3TFQ1 196 aa21.08■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Upf3bQ3ULL6 472 aa21.08■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vps72Q62481 368 aa21.08■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cog3Q8CI04 820 aa21.08■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Celf3Q8CIN6 465 aa21.08■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Smc6Q924W5 1097 aa21.08■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ddx47Q9CWX9 455 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tbc1d15Q9CXF4 671 aa21.08■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Snx29Q9D3S3 818 aa21.08■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 PolkQ9QUG2 852 aa21.08■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Il27raO70394 623 aa21.07■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tnnc2P20801 160 aa21.07■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nploc4P60670 608 aa21.07■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pnpla5Q32LZ8 432 aa21.07■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dab2ipQ3UHC7 1189 aa21.07■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Stip1Q60864 543 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sh3gl2Q62420 352 aa21.07■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 PnocQ64387 187 aa21.07■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Prmt6Q6NZB1 378 aa21.07■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rpf1Q7TND5 349 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm5622Q810Q0 167 aa21.07■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pknox2Q8BG99 474 aa21.07■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Snx14Q8BHY8 964 aa21.07■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mettl24Q8CCB5 363 aa21.07■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gtpbp10Q8K013 366 aa21.07■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Btbd6Q8K2J9 488 aa21.07■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lrrc56Q8K375 552 aa21.07■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Socs4Q91ZA6 436 aa21.07■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pdzd4Q9QY39 772 aa21.07■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gadd45gQ9Z111 159 aa21.07■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rap1gapA2ALS5 663 aa21.06■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ccdc152E9PX14 254 aa21.06■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm17535J3KMR8 224 aa21.06■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ptp4a2O70274 167 aa21.06■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Serpinh1P19324 417 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 NfiaQ02780 532 aa21.06■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sh3bp2Q06649 559 aa21.06■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zmym1Q3TJB1 983 aa21.06■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nr1d1Q3UV55 615 aa21.06■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tspyl3Q3UYP3 334 aa21.06■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 NostrinQ6WKZ7 506 aa21.06■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr392Q7TRX6 312 aa21.06■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Znf12Q7TSI0 686 aa21.06■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vat1lQ80TB8 417 aa21.06■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Micall1Q8BGT6 870 aa21.06■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rufy1Q8BIJ7 712 aa21.06■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 C130026I21RikQ8C898 291 aa21.06■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 ClasrpQ8CFC7 668 aa21.06■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Atp13a1Q9EPE9 1200 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm1661E9Q963 441 aa21.06■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hspa9P38647 679 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rnf157Q3TEL6 685 aa21.06■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hexim2Q3TVI4 313 aa21.06■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nlgn2Q69ZK9 836 aa21.06■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Apol9bQ8C7I4 310 aa21.06■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Apol9aQ8VDU3 310 aa21.06■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Map4k3Q99JP0 894 aa21.06■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tsnaxip1Q99P25 704 aa21.06■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 ArpinQ9D0A3 226 aa21.06■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Calr3Q9D9Q6 380 aa21.06■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm11985A0A1B0GS61 206 aa21.05■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ptpn3A2ALK8 913 aa21.05■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lrrc63A6H694 637 aa21.05■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm3182K7N6T8 263 aa21.05■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nr3c1P06537 783 aa21.05■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cdca2Q14B71 982 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Six1Q62231 284 aa21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.1 ms