RNA–Protein interactions for RNA: YJL104W

PAM16, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM16, Length 450 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM16	YJL104W	IMA3	P0CW40	589 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	IMA4	P0CW41	589 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	SCO1	P23833	295 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	HSP30	P25619	332 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	PTM1	P32857	523 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	MDL1	P33310	695 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	NUF2	P33895	451 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	LTV1	P34078	463 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	YET1	P35723	206 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	MCH2	P36032	473 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	JEN1	P36035	616 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	RIB1	P38066	345 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	YHL049C	P38722	271 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	YHR035W	P38769	630 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	MPC2	P38857	129 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	ATG7	P38862	630 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	MET28	P40573	187 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	YFR054C	P43622	192 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	FIP1	P45976	327 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	CIN2	P46670	268 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	TRS85	P46944	698 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	VPS55	P47111	140 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	XPT1	P47165	209 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	BRR6	P53062	197 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	TWF1	P53250	332 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	RMI1	Q02685	241 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	YDR476C	Q03362	224 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	SCS7	Q03529	384 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	YDR248C	Q03786	193 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	TAF11	Q04226	346 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	HSP31	Q04432	237 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	YLR173W	Q06247	608 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	ARV1	Q06541	321 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	COQ10	Q08058	207 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	IMA2	Q08295	589 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	GRE1	Q08969	168 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	BTS1	Q12051	335 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	MSH5	Q12175	901 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	MCT1	Q12283	360 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	ATO3	Q12359	275 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	HMS1	Q12398	434 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	YPL229W	Q99395	206 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	CKA1	P15790	372 aa		0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	MER1	P16523	270 aa		0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	PPA2	P28239	310 aa		0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	PEX3	P28795	441 aa		0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	MRE11	P32829	692 aa		0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	YBL029W	P38201	376 aa		0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	IST2	P38250	946 aa		0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	BIG1	P38813	335 aa		0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	END3	P39013	349 aa		0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	CAJ1	P39101	391 aa		0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	DDI1	P40087	428 aa		0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	SLM1	P40485	686 aa		0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	PIR5	P46999	287 aa		0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	TTI2	P47168	421 aa		0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	GPI8	P49018	411 aa		0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	PHB2	P50085	310 aa		0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	ALG13	P53178	202 aa		0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	GTR2	P53290	341 aa		0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	OKP1	P53298	406 aa		0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	COX12	Q01519	83 aa		0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	SGF11	Q03067	99 aa		0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	SRL4	Q03085	281 aa		0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	YMR010W	Q03687	405 aa		0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	CSN9	Q03981	162 aa		0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	YDR391C	Q04170	232 aa		0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	NNT1	Q05874	261 aa		0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	ASA1	Q06822	443 aa		0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	IRC23	Q08416	157 aa		0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	BBP1	Q12365	385 aa		0.72	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	DST1	P07273	309 aa		0.71	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	ATP10	P18496	279 aa		0.71	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	CPR2	P23285	205 aa		0.71	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	HXT2	P23585	541 aa		0.71	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	INO2	P26798	304 aa		0.71	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	OCH1	P31755	480 aa		0.71	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	ERG2	P32352	222 aa		0.71	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	TFC1	P32367	649 aa		0.71	□□□□□ -2.3

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