RNA–Protein interactions for RNA: YHR064C

SSZ1, Transcript of Hsp70 protein that interacts with Zuo1p (a DnaJ homolog), yeast

Gene SSZ1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSZ1	YHR064C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	HEM25	Q07534	307 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	HRT1	Q08273	121 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	YDR262W	Q12331	272 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	YLR118C	Q12354	227 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	OPI3	P05375	206 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	PPH21	P23594	369 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	PTP1	P25044	335 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	URK1	P27515	501 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	PRO1	P32264	428 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	SSS1	P35179	80 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	RIB5	P38145	238 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	YEA4	P40004	342 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	YIL067C	P40514	678 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	AIM24	P47127	394 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	MGA1	P53050	456 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	YGR066C	P53242	292 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	FHN1	P53279	174 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	ACS1	Q01574	713 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	HOF1	Q05080	669 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	ASM4	Q05166	528 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	MED7	Q08278	222 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	SRO7	Q12038	1033 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	NPC2	Q12408	173 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	MRP10	O75012	95 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	ERG3	P32353	365 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	SPC29	P33419	253 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	FAT1	P38225	669 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	TRS20	P38334	175 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	YBR292C	P38357	123 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	SUR2	P38992	349 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	XBP1	P40489	647 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	ZIM17	P42844	174 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	YNR066C	P53752	436 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	CTR3	Q06686	241 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	RAD28	Q12021	506 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	RLM1	Q12224	676 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	PCL2	P25693	308 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	LAC1	P28496	418 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	REC104	P33323	182 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	YIL077C	P40508	320 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	NIT2	P47016	307 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	SNO2	P53823	222 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	COA6	Q3E846	104 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	SCEI	P03882	235 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	MRPL44	P19956	98 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	FRM2	P37261	193 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	MRPS9	P38120	278 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	YBR013C	P38215	129 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	MED6	P38782	295 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.73	□□□□□ -1.65	not detected
SSZ1	YHR064C	YER158C	P40095	573 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	LRO1	P40345	661 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	FLX1	P40464	311 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	PHS1	P40857	217 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	YGL262W	P53054	175 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	OCA2	P53949	197 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	SAM50	P53969	484 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	YDC1	Q02896	317 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	NRG1	Q03125	231 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	ADD37	Q03233	198 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	THI74	Q04083	370 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	AVO2	Q04749	426 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	ENB1	Q08299	606 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	MSW1	P04803	379 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	CPR2	P23285	205 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	POP5	P28005	173 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	SCM4	P32564	187 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	WSS1	P38838	269 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	YJR096W	P47137	282 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	YGL114W	P53134	725 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	BSC5	P53755	489 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SSZ1	YHR064C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65

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