RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639956.1

SPIN3-232, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,998 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-232ENST00000639956 UBE4BO95155 1302 aa13.31□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 GOLGA8SH3BPF8 625 aa13.31□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 GOLGA8MH3BSY2 632 aa13.31□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 RARGP13631 454 aa13.31□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 TAS2R40P59535 323 aa13.31□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 ADCY2Q08462 1091 aa13.31□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 CNGA2Q16280 664 aa13.31□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 ACAD10Q6JQN1 1059 aa13.31□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 FAM160B2Q86V87 743 aa13.31□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 GLIS1Q8NBF1 620 aa13.31□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 ZNF516Q92618 1163 aa13.31□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 ART4Q93070 314 aa13.31□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 RPS6KC1Q96S38 1066 aa13.31□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 GTF3C4Q9UKN8 822 aa13.31□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 PSMC5P62195 406 aa13.31□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 SYCP2LQ5T4T6 812 aa13.31□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 CNKSR1Q969H4 720 aa13.31□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 ATG4CQ96DT6 458 aa13.31□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 PGM2Q96G03 612 aa13.31□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 ANAPC5Q9UJX4 755 aa13.31□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 PNMA3Q9UL41 463 aa13.31□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 L3MBTL1Q9Y468 752 aa13.31□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 UMODL1Q5DID0 1318 aa13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 TP73O15350 636 aa13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 UBOX5O94941 541 aa13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 BRAFP15056 766 aa13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 HSD17B4P51659 736 aa13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 KCNJ2P63252 427 aa13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 SNCBQ16143 134 aa13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 PPP2R5EQ16537 467 aa13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 NLRX1Q86UT6 975 aa13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 TMEM130Q8N3G9 435 aa13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 FNBP1Q96RU3 617 aa13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 TMEM8AQ9HCN3 771 aa13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 ATAD5Q96QE3 1844 aa13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 MROH7Q68CQ1 1323 aa13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 A8MUI8 341 aa13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 GRIN3BO60391 1043 aa13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 BANF1O75531 89 aa13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 IFNB1P01574 187 aa13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 ATF2P15336 505 aa13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 PTGER2P43116 358 aa13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 NSFP46459 744 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 TRAF1Q13077 416 aa13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 TMED2Q15363 201 aa13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 KIFAP3Q92845 792 aa13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 PDCD2LQ9BRP1 358 aa13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 KIF9Q9HAQ2 790 aa13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 C1orf112Q9NSG2 853 aa13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 PTPRJQ12913 1337 aa13.3□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 C5orf60A6NFR6 353 aa13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 AGTP01019 485 aa13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 CYP1A2P05177 515 aa13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 ASNSP08243 561 aa13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 PAEPP09466 180 aa13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 GZMAP12544 262 aa13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 MAP2K2P36507 400 aa13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 DYNLT1P63172 113 aa13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 CYP24A1Q07973 514 aa13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 SLMAPQ14BN4 828 aa13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 CCDC63Q8NA47 563 aa13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 SPOCK2Q92563 424 aa13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 PAGR1Q9BTK6 254 aa13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 NRXN2Q9P2S2 1712 aa13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 LRRIQ4A6NIV6 560 aa13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 WDR64B1ANS9 1081 aa13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 WNT10BO00744 389 aa13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 DSG3P32926 999 aa13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 PIK3CAP42336 1068 aa13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 LIG4P49917 911 aa13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 PLCB3Q01970 1234 aa13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 ZNF365Q70YC5 407 aa13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 MCOLN2Q8IZK6 566 aa13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 PARP2Q9UGN5 583 aa13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 RFX1P22670 979 aa13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 CDC25CP30307 473 aa13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 SPDYE2Q495Y8 402 aa13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 C7orf43Q8WVR3 580 aa13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 SGSM3Q96HU1 749 aa13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa13.28□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 C10orf71Q711Q0 1435 aa13.28□□□□□ -0.28
SPIN3-232ENST00000639956 CHUKO15111 745 aa13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms