RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616306.1

UBXN8-208, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN8, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-208ENST00000616306 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
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UBXN8-208ENST00000616306 VWA3AA6NCI4 1184 aa11.15□□□□□ -0.62
UBXN8-208ENST00000616306 PI4K2BG5E9Z4 385 aa11.15□□□□□ -0.62
UBXN8-208ENST00000616306 K7ERI5 159 aa11.15□□□□□ -0.62
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UBXN8-208ENST00000616306 KCNK18Q7Z418 384 aa11.15□□□□□ -0.62
UBXN8-208ENST00000616306 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
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UBXN8-208ENST00000616306 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
UBXN8-208ENST00000616306 TNFSF13BQ9Y275 285 aa11.13□□□□□ -0.63
UBXN8-208ENST00000616306 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
UBXN8-208ENST00000616306 LOC730098B7Z3J9 87 aa11.12□□□□□ -0.63
UBXN8-208ENST00000616306 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
UBXN8-208ENST00000616306 MAN1A2O60476 641 aa11.12□□□□□ -0.63
UBXN8-208ENST00000616306 GPR37L1O60883 481 aa11.12□□□□□ -0.63
UBXN8-208ENST00000616306 RECQL4O94761 1208 aa11.12□□□□□ -0.63
UBXN8-208ENST00000616306 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.63
UBXN8-208ENST00000616306 THP07101 528 aa11.12□□□□□ -0.63
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