RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616206.4

PDE4DIP-241, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PDE4DIP, Length 874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-241ENST00000616206 NACAP1Q9BZK3 213 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZHX3Q9H4I2 956 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 SH2D4AQ9H788 454 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 IPPKQ9H8X2 491 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 TXNRD2Q9NNW7 524 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 CATSPERZQ9NTU4 200 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 FAM105AQ9NUU6 356 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 CLEC1BQ9P126 229 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 RBPJLQ9UBG7 517 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 BAHCC1Q9P281 2608 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 A0A1W2PRG0 241 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 MEGF11A6BM72 1044 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 A6NNZ2 444 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 AURKAO14965 403 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 SIGLEC6O43699 453 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 SLITRK5O94991 958 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 WISP1O95388 367 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 PRAMEF1O95521 474 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 PLS3P13797 630 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 ARHGAP44Q17R89 818 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 KIZQ2M2Z5 673 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 ALFQ53S48 1182 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 CREB3L3Q68CJ9 461 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 RASSF3Q86WH2 238 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 EXOC6Q8TAG9 804 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 C12orf42Q96LP6 360 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 NAPBQ9H115 298 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZNF287Q9HBT7 754 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 HOXC10Q9NYD6 342 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 MORF4L1Q9UBU8 362 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 IPPQ9Y573 584 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 ACTL7BQ9Y614 415 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 TPP1O14773 563 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 MAFGO15525 162 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 SLC26A4O43511 780 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 PRDM1O75626 825 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 FLOT1O75955 427 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 GJB1P08034 283 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 EPXP11678 715 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 EEF2P13639 858 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 SLC9A1P19634 815 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 AKAP5P24588 427 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 SEPHS1P49903 392 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 COG2Q14746 738 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 TERF2Q15554 542 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 GPR142Q7Z601 462 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 PLEKHH3Q7Z736 793 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZBTB34Q8NCN2 500 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 RILPL2Q969X0 211 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 DEFB118Q96PH6 123 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 PORCNQ9H237 461 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 MS4A5Q9H3V2 200 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 MYH1P12882 1939 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 HMGCRP04035 888 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 IFNGR1P15260 489 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 LSP1P33241 339 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 RGS2P41220 211 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 MRE11P49959 708 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 PDE1AP54750 535 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 CRY1Q16526 586 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 SBK1Q52WX2 424 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 CRTC3Q6UUV7 619 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 CCDC149Q6ZUS6 474 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 ACAD11Q709F0 780 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 C16orf59Q7L2K0 433 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 PCGF5Q86SE9 256 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 MIER2Q8N344 545 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 TEX19Q8NA77 164 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 RCBTB1Q8NDN9 531 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 LMBR1Q8WVP7 490 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 POF1BQ8WVV4 589 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 SOCS4Q8WXH5 440 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 JADE3Q92613 823 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 LPAR1Q92633 364 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 VCPKMTQ9H867 229 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 FAM204AQ9H8W3 233 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 SUGCTQ9HAC7 445 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 TOMM22Q9NS69 142 aa8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms