RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601247.5

FCHO1-235, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 458 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-235ENST00000601247 PIK3CAP42336 1068 aa16.52■□□□□ 0.24
FCHO1-235ENST00000601247 FAM189BP81408 668 aa16.52■□□□□ 0.24
FCHO1-235ENST00000601247 TRPC3Q13507 836 aa16.52■□□□□ 0.24
FCHO1-235ENST00000601247 MIIPQ5JXC2 388 aa16.52■□□□□ 0.24
FCHO1-235ENST00000601247 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
FCHO1-235ENST00000601247 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
FCHO1-235ENST00000601247 LINC01599Q8WXQ3 324 aa16.52■□□□□ 0.24
FCHO1-235ENST00000601247 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
FCHO1-235ENST00000601247 IMPG2Q9BZV3 1241 aa16.52■□□□□ 0.24
FCHO1-235ENST00000601247 INTS13Q9NVM9 706 aa16.52■□□□□ 0.24
FCHO1-235ENST00000601247 CNTN3Q9P232 1028 aa16.52■□□□□ 0.24
FCHO1-235ENST00000601247 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
FCHO1-235ENST00000601247 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa16.52■□□□□ 0.24
FCHO1-235ENST00000601247 THP07101 528 aa16.51■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 NFICP08651 508 aa16.51■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 TPM1P09493 284 aa16.51■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 PPP3CAQ08209 521 aa16.51■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 NR1I3Q14994 352 aa16.51■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 EXOC3L4Q17RC7 722 aa16.51■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 WDR44Q5JSH3 913 aa16.51■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 PLEKHO2Q8TD55 490 aa16.51■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 RSPH1Q8WYR4 309 aa16.51■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa16.51■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 GAD1Q99259 594 aa16.51■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 MTMR12Q9C0I1 747 aa16.51■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 GCNT4Q9P109 453 aa16.51■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 ARL5CA6NH57 179 aa16.5■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 KRT19P08727 400 aa16.5■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 KCNE1P15382 129 aa16.5■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 CLDN10P78369 228 aa16.5■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 GLRA4Q5JXX5 417 aa16.5■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 AGMOQ6ZNB7 445 aa16.5■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 SV2AQ7L0J3 742 aa16.5■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa16.5■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 FBXL13Q8NEE6 735 aa16.5■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 HELQQ8TDG4 1101 aa16.5■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 TMEM117Q9H0C3 514 aa16.5■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 KANSL3Q9P2N6 904 aa16.5■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 ITGA11Q9UKX5 1188 aa16.5■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa16.49■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 A0A1W2PQC6 194 aa16.49■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 TEX33O43247 280 aa16.49■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 UPP2O95045 317 aa16.49■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 SCNN1GP51170 649 aa16.49■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 WNT7BP56706 349 aa16.49■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 GRIK3Q13003 919 aa16.49■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 SCN5AQ14524 2016 aa16.49■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 SYCP1Q15431 976 aa16.49■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 TCTN1Q2MV58 587 aa16.49■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 CBWD6Q4V339 395 aa16.49■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 NOMO2Q5JPE7 1267 aa16.49■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 CBWD3Q5JTY5 395 aa16.49■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 CBWD5Q5RIA9 395 aa16.49■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 C1orf220Q5T0J3 134 aa16.49■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 OTOP2Q7RTS6 562 aa16.49■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 EFCAB13Q8IY85 973 aa16.49■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 NEK11Q8NG66 645 aa16.49■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 OR5B17Q8NGF7 314 aa16.49■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 ZFP42Q96MM3 310 aa16.49■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 DPP3Q9NY33 737 aa16.49■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP16.49■□□□□ 0.232e-8■■■□□ 18.1
FCHO1-235ENST00000601247 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 PMM2O15305 246 aa16.48■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 AP5Z1O43299 807 aa16.48■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 POMCP01189 267 aa16.48■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 FGFR1P11362 822 aa16.48■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 CYP3A5P20815 502 aa16.48■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 WDR5P61964 334 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 RBP5P82980 135 aa16.48■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 NCOA4Q13772 614 aa16.48■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 ZACNQ401N2 412 aa16.48■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 XKR4Q5GH76 650 aa16.48■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 ALKAL1Q6UXT8 129 aa16.48■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP16.48■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 ZNF365Q70YC5 407 aa16.48■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 TMC6Q7Z403 805 aa16.48■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 PPFIBP1Q86W92 1011 aa16.48■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 ZNF516Q92618 1163 aa16.48■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 IQCDQ96DY2 449 aa16.48■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 ERGIC2Q96RQ1 377 aa16.48■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 CRACR2AQ9BSW2 395 aa16.48■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 RAB20Q9NX57 234 aa16.48■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 ALPK3Q96L96 1907 aa16.48■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 PTPRJQ12913 1337 aa16.47■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 MEIS3P2A8K0S8 358 aa16.47■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 OFD1O75665 1012 aa16.47■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 HLA-DRAP01903 254 aa16.47■□□□□ 0.23
FCHO1-235ENST00000601247 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms