RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599811.5

CD22-223, Transcript of CD22 molecule, human

TSL 4

Gene CD22, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CD22-223	ENST00000599811	CALM2	P0DP24	149 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	CALM3	P0DP25	149 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	PTPN2	P17706	415 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	RXRA	P19793	462 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	SMARCA1	P28370	1054 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	GBP1	P32455	592 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	UVSSA	Q2YD98	709 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	KSR1	Q8IVT5	923 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	GPR65	Q8IYL9	337 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	HACE1	Q8IYU2	909 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	CNNM3	Q8NE01	707 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	NCOA7	Q8NI08	942 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	ZFP42	Q96MM3	310 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	CORO1B	Q9BR76	489 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	DISC1	Q9NRI5	854 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	IPP	Q9Y573	584 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	KNTC1	P50748	2209 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	PTPN13	Q12923	2485 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	LNP1	A1A4G5	178 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	FAM86B1	E9PN63	330 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	CCER2	I3L3R5	266 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	HIP1	O00291	1037 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	ZNF197	O14709	1029 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	ZNF862	O60290	1169 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	HOXC13	P31276	330 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	ELF1	P32519	619 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	OR1D2	P34982	312 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	CLCN1	P35523	988 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	SREBF1	P36956	1147 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	SOX9	P48436	509 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	DSC1	Q08554	894 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	AP3B2	Q13367	1082 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	PON2	Q15165	354 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	UGCG	Q16739	394 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	PLK5	Q496M5	336 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	PRR16	Q569H4	304 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	PDXDC1	Q6P996	788 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	CASC1	Q6TDU7	716 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	VIT	Q6UXI7	678 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	TTC8	Q8TAM2	541 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	SMARCD2	Q92925	531 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	MSANTD3	Q96H12	275 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	ASB16	Q96NS5	453 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	MAP3K14	Q99558	947 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	MIOS	Q9NXC5	875 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	HES2	Q9Y543	173 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	WDR27	A2RRH5	827 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	TMEM150B	A6NC51	233 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	SMCO2	A6NFE2	343 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	PRRG1	O14668	218 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	ADAM12	O43184	909 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	EXTL3	O43909	919 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	GAS7	O60861	476 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	AKAP3	O75969	853 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	EFEMP2	O95967	443 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	POU2F2	P09086	479 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	FCAR	P24071	287 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	HOXA6	P31267	233 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	VIPR2	P41587	438 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	SCAP	Q12770	1279 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	GRIK3	Q13003	919 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	UBXN11	Q5T124	520 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CD22-223	ENST00000599811	NOTUM	Q6P988	496 aa		6.66	□□□□□ -1.34

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